基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2012年
5期
505-512
,共8页
史卫东*%黄如葵%陈振东%罗海玲%康红卫%梁家作%刘杏连
史衛東*%黃如葵%陳振東%囉海玲%康紅衛%樑傢作%劉杏連
사위동*%황여규%진진동%라해령%강홍위%량가작%류행련
芥蓝%表观遗传多样性%MSAP分析
芥藍%錶觀遺傳多樣性%MSAP分析
개람%표관유전다양성%MSAP분석
本研究利用 MSAP 检测18个芥蓝齐口期 DNA 甲基化水平,分析了表观遗传多样性,探讨 DNA 甲基化模式对齐口期的影响.结果表明,18个芥蓝齐口期平均为50 d,叶片数平均为10片,齐口期和叶片数不相关(相关系数为0.296);变异系数分别为21%和18%;遗传距离分布在0~40,平均值为12.2276,在10.62处分为3类.MSAP 分析表明,5对引物组合扩增得到432条多态性条带,201条片段表现出多态性,多态性比率为47%;Nei 遗传距离分布在0.004~0.467,平均值为0.0958,表明遗传多样性水平较低;在0.04处分为3类.Mantel 测验表明两种分析的遗传距离相关系数为-0.1366,显示齐口期、叶片数与 DNA 甲基化多态性没有相关性.DNA 甲基化模式分析表明,非甲基化片段为110条,甲基化多态性片段为322条,分为3 种带型,类型一为非甲基化带型(110条),类型二为甲基化带型(110条),类型三为半甲基化带型(152条),非甲基化片段和半甲基化片段在不同品种之间呈现多态性,甲基化片段在不同品种之间呈现多态性与单态性相差不大,显示 MSAP 多态性主要来源于非甲基化和半甲基化片段,芥蓝甲基化模式以半甲基化为主.本文推测DNA 甲基化水平降低参与芥蓝齐口期调控,MSAP 分析既可用于基因组结构研究,又可用于基因组水平上性状的功能研究.
本研究利用 MSAP 檢測18箇芥藍齊口期 DNA 甲基化水平,分析瞭錶觀遺傳多樣性,探討 DNA 甲基化模式對齊口期的影響.結果錶明,18箇芥藍齊口期平均為50 d,葉片數平均為10片,齊口期和葉片數不相關(相關繫數為0.296);變異繫數分彆為21%和18%;遺傳距離分佈在0~40,平均值為12.2276,在10.62處分為3類.MSAP 分析錶明,5對引物組閤擴增得到432條多態性條帶,201條片段錶現齣多態性,多態性比率為47%;Nei 遺傳距離分佈在0.004~0.467,平均值為0.0958,錶明遺傳多樣性水平較低;在0.04處分為3類.Mantel 測驗錶明兩種分析的遺傳距離相關繫數為-0.1366,顯示齊口期、葉片數與 DNA 甲基化多態性沒有相關性.DNA 甲基化模式分析錶明,非甲基化片段為110條,甲基化多態性片段為322條,分為3 種帶型,類型一為非甲基化帶型(110條),類型二為甲基化帶型(110條),類型三為半甲基化帶型(152條),非甲基化片段和半甲基化片段在不同品種之間呈現多態性,甲基化片段在不同品種之間呈現多態性與單態性相差不大,顯示 MSAP 多態性主要來源于非甲基化和半甲基化片段,芥藍甲基化模式以半甲基化為主.本文推測DNA 甲基化水平降低參與芥藍齊口期調控,MSAP 分析既可用于基因組結構研究,又可用于基因組水平上性狀的功能研究.
본연구이용 MSAP 검측18개개람제구기 DNA 갑기화수평,분석료표관유전다양성,탐토 DNA 갑기화모식대제구기적영향.결과표명,18개개람제구기평균위50 d,협편수평균위10편,제구기화협편수불상관(상관계수위0.296);변이계수분별위21%화18%;유전거리분포재0~40,평균치위12.2276,재10.62처분위3류.MSAP 분석표명,5대인물조합확증득도432조다태성조대,201조편단표현출다태성,다태성비솔위47%;Nei 유전거리분포재0.004~0.467,평균치위0.0958,표명유전다양성수평교저;재0.04처분위3류.Mantel 측험표명량충분석적유전거리상관계수위-0.1366,현시제구기、협편수여 DNA 갑기화다태성몰유상관성.DNA 갑기화모식분석표명,비갑기화편단위110조,갑기화다태성편단위322조,분위3 충대형,류형일위비갑기화대형(110조),류형이위갑기화대형(110조),류형삼위반갑기화대형(152조),비갑기화편단화반갑기화편단재불동품충지간정현다태성,갑기화편단재불동품충지간정현다태성여단태성상차불대,현시 MSAP 다태성주요래원우비갑기화화반갑기화편단,개람갑기화모식이반갑기화위주.본문추측DNA 갑기화수평강저삼여개람제구기조공,MSAP 분석기가용우기인조결구연구,우가용우기인조수평상성상적공능연구.