海洋科学
海洋科學
해양과학
MARINE SCIENCES
2012年
9期
82-88
,共7页
藤壶科%条形码%DNA%亚科%系统发育
籐壺科%條形碼%DNA%亞科%繫統髮育
등호과%조형마%DNA%아과%계통발육
围胸总目藤壶科的分类系统经历了二亚科系统(小藤壶亚科 Chthamalinae,藤壶亚科 Balaninae)、三亚科系统[藤壶亚科(Balaninae),巨藤壶亚科(Megabalaninae),凹藤壶亚科(Concavinae)],现在采用的是四亚科系统[藤壶亚科(Balaniae)、纹藤壶亚科(Amphibalanus)、巨藤壶亚科(Megabalaninae)和凹藤壶亚科(Concavinae)],但各亚科之间的系统演化关系尚未进行过分子系统学方面的研究.许多藤壶科物种存在趋同进化的趋势,致使传统的形态分类存在困难,不能正确地进行鉴别.本文测定了藤壶科3个亚科里个代表种的线粒体 COI,16S 和12S 基因的部分序列,结合 GenBank 中藤壶科其他物种的12S,28S和18S等基因序列,比较了不同基因片段作为鉴别藤壶科物种的条形码的可行性和有效性,并联合16S和12S序列初步分析了藤壶科各亚科之间的一些亲缘关系.研究结果表明:COI基因的种间和种内遗传距离有明显的间隔区, COI最小种间距离为0.122,远大于最大种内距离0.023,而16S基因的种间与种内距离存在覆盖,最小种间距离为0.018,小于最大种内距离0.023,因此表明,线粒体基因 COI能更准确地鉴定藤壶科种间以及种内关系,并得出阈值为种内差异小于0.023,种间差异大于0.1.ML和BI系统发育分析结果基本一致,支持4亚科的分类系统;巨藤壶亚科形成明显单系群,支持率很高,而两种纹藤壶和管藤壶聚成一支,形成一个单系,本结果支持Newman & Ross的假说,即纹藤壶属和管藤壶属应合并.
圍胸總目籐壺科的分類繫統經歷瞭二亞科繫統(小籐壺亞科 Chthamalinae,籐壺亞科 Balaninae)、三亞科繫統[籐壺亞科(Balaninae),巨籐壺亞科(Megabalaninae),凹籐壺亞科(Concavinae)],現在採用的是四亞科繫統[籐壺亞科(Balaniae)、紋籐壺亞科(Amphibalanus)、巨籐壺亞科(Megabalaninae)和凹籐壺亞科(Concavinae)],但各亞科之間的繫統縯化關繫尚未進行過分子繫統學方麵的研究.許多籐壺科物種存在趨同進化的趨勢,緻使傳統的形態分類存在睏難,不能正確地進行鑒彆.本文測定瞭籐壺科3箇亞科裏箇代錶種的線粒體 COI,16S 和12S 基因的部分序列,結閤 GenBank 中籐壺科其他物種的12S,28S和18S等基因序列,比較瞭不同基因片段作為鑒彆籐壺科物種的條形碼的可行性和有效性,併聯閤16S和12S序列初步分析瞭籐壺科各亞科之間的一些親緣關繫.研究結果錶明:COI基因的種間和種內遺傳距離有明顯的間隔區, COI最小種間距離為0.122,遠大于最大種內距離0.023,而16S基因的種間與種內距離存在覆蓋,最小種間距離為0.018,小于最大種內距離0.023,因此錶明,線粒體基因 COI能更準確地鑒定籐壺科種間以及種內關繫,併得齣閾值為種內差異小于0.023,種間差異大于0.1.ML和BI繫統髮育分析結果基本一緻,支持4亞科的分類繫統;巨籐壺亞科形成明顯單繫群,支持率很高,而兩種紋籐壺和管籐壺聚成一支,形成一箇單繫,本結果支持Newman & Ross的假說,即紋籐壺屬和管籐壺屬應閤併.
위흉총목등호과적분류계통경력료이아과계통(소등호아과 Chthamalinae,등호아과 Balaninae)、삼아과계통[등호아과(Balaninae),거등호아과(Megabalaninae),요등호아과(Concavinae)],현재채용적시사아과계통[등호아과(Balaniae)、문등호아과(Amphibalanus)、거등호아과(Megabalaninae)화요등호아과(Concavinae)],단각아과지간적계통연화관계상미진행과분자계통학방면적연구.허다등호과물충존재추동진화적추세,치사전통적형태분류존재곤난,불능정학지진행감별.본문측정료등호과3개아과리개대표충적선립체 COI,16S 화12S 기인적부분서렬,결합 GenBank 중등호과기타물충적12S,28S화18S등기인서렬,비교료불동기인편단작위감별등호과물충적조형마적가행성화유효성,병연합16S화12S서렬초보분석료등호과각아과지간적일사친연관계.연구결과표명:COI기인적충간화충내유전거리유명현적간격구, COI최소충간거리위0.122,원대우최대충내거리0.023,이16S기인적충간여충내거리존재복개,최소충간거리위0.018,소우최대충내거리0.023,인차표명,선립체기인 COI능경준학지감정등호과충간이급충내관계,병득출역치위충내차이소우0.023,충간차이대우0.1.ML화BI계통발육분석결과기본일치,지지4아과적분류계통;거등호아과형성명현단계군,지지솔흔고,이량충문등호화관등호취성일지,형성일개단계,본결과지지Newman & Ross적가설,즉문등호속화관등호속응합병.