海洋科学
海洋科學
해양과학
MARINE SCIENCES
2012年
9期
89-95
,共7页
张源真%王伟%姜志强%张钊
張源真%王偉%薑誌彊%張釗
장원진%왕위%강지강%장쇠
鳚亚目(Blennioidei)%线粒体DNA%16S rRNA基因序列%系统发育
鳚亞目(Blennioidei)%線粒體DNA%16S rRNA基因序列%繫統髮育
위아목(Blennioidei)%선립체DNA%16S rRNA기인서렬%계통발육
通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基,结合来自 GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段,并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统发育树.结果显示:在鳚亚目鱼类的16S rRNA 片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有207 bp变异位点,转换/颠换值为0.8,碱基平均差异为3.36;支持绵鳚(Enchelyopus elongates)归于鳚亚目绵鳚科(Zoarcidae),鳚(Azuma emmnion)归于鳚亚目线鳚科(Stichaeidae);方氏云鳚(Enedrias fangi)和云鳚(Enedrias nebulosus)种间遗传距离只有0.01,亲缘关系最近.
通過PCR擴增穫得瞭3科5屬6種中國黃渤海海域的鳚亞目(Blennioidei)魚類的線粒體16S rRNA基因序列片段約669bp堿基,結閤來自 GenBank的5種鳚亞目其他科魚類的相應基因片段,併以眼斑雪冰魚(Chionodraco rastrospinosus)為外群,生成供繫統髮育分析的序列矩陣,利用MEGA 4.0軟件分析序列的堿基組成、差異百分比、轉換/顛換值等,應用最大簡約法(MP)和鄰接法(NJ)構建繫統髮育樹.結果顯示:在鳚亞目魚類的16S rRNA 片段生成的序列矩陣中髮現有堿基的插入缺失現象,共有207 bp變異位點,轉換/顛換值為0.8,堿基平均差異為3.36;支持綿鳚(Enchelyopus elongates)歸于鳚亞目綿鳚科(Zoarcidae),鳚(Azuma emmnion)歸于鳚亞目線鳚科(Stichaeidae);方氏雲鳚(Enedrias fangi)和雲鳚(Enedrias nebulosus)種間遺傳距離隻有0.01,親緣關繫最近.
통과PCR확증획득료3과5속6충중국황발해해역적위아목(Blennioidei)어류적선립체16S rRNA기인서렬편단약669bp감기,결합래자 GenBank적5충위아목기타과어류적상응기인편단,병이안반설빙어(Chionodraco rastrospinosus)위외군,생성공계통발육분석적서렬구진,이용MEGA 4.0연건분석서렬적감기조성、차이백분비、전환/전환치등,응용최대간약법(MP)화린접법(NJ)구건계통발육수.결과현시:재위아목어류적16S rRNA 편단생성적서렬구진중발현유감기적삽입결실현상,공유207 bp변이위점,전환/전환치위0.8,감기평균차이위3.36;지지면위(Enchelyopus elongates)귀우위아목면위과(Zoarcidae),위(Azuma emmnion)귀우위아목선위과(Stichaeidae);방씨운위(Enedrias fangi)화운위(Enedrias nebulosus)충간유전거리지유0.01,친연관계최근.
