CAJ | 학술논문

凋亡蛋白对于物种发育和生物体内平衡的维持发挥着非常重要的作用.对凋亡蛋白的亚细胞位点的准确预测有利于理解细胞程序性死亡的机理和其生物学功能.本文利用SignalP得到的裂解位点将肽链分成N-端信号序列和成熟端序列.通过提取两端序列的氨基酸组分(ACC)、伪氨基酸组分(Pse-AAC)和整个链的立体化学特性来描述一条蛋白质序列.最后将得到的特征向量输入到支持向量机(SVM)中来预测其亚细胞位置.对三个凋亡蛋白基准数据集进行Jackknife验证,得到的总体精度分别为93.9%,87.6%,91.5%.此外我们还利用了由Reinhardt和Hubbard构建的非凋亡蛋白基准测试数据集(NNPSL数据集)来验证本文的方法,对于真核和原核蛋白的预测准确度分别达到87.7%和94.8%.
조망단백대우물충발육화생물체내평형적유지발휘착비상중요적작용.대조망단백적아세포위점적준학예측유리우리해세포정서성사망적궤리화기생물학공능.본문이용SignalP득도적렬해위점장태련분성N-단신호서렬화성숙단서렬.통과제취량단서렬적안기산조분(ACC)、위안기산조분(Pse-AAC)화정개련적입체화학특성래묘술일조단백질서렬.최후장득도적특정향량수입도지지향량궤(SVM)중래예측기아세포위치.대삼개조망단백기준수거집진행Jackknife험증,득도적총체정도분별위93.9%,87.6%,91.5%.차외아문환이용료유Reinhardt화Hubbard구건적비조망단백기준측시수거집(NNPSL수거집)래험증본문적방법,대우진핵화원핵단백적예측준학도분별체도87.7%화94.8%.