浙江大学学报（农业与生命科学版）
浙江大學學報（農業與生命科學版）
절강대학학보（농업여생명과학판）
JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY(AGRICULTURE & LIFE SCIENCES)
2012年
4期
370-376
,共7页
总状毛霉%丝氨酸蛋白酶基因%生物信息学分析
總狀毛黴%絲氨痠蛋白酶基因%生物信息學分析
총상모매%사안산단백매기인%생물신식학분석
利用 PCR和RACE(cDNA末端快速扩增)技术从总状毛霉中克隆获得1个丝氨酸蛋白酶新基因,利用生物信息学方法对该基因序列、编码的酶序列以及酶性质和结构进行预测.结果表明:该基因编码区序列长1421 bp ,由3个外显子和2个内含子组成,编码由429个氨基酸残基组成的多肽;对该多肽的组成和进化分析表明,其成熟肽属于蛋白酶K家族的胞外蛋白酶;通过同源建模结构分析表明,该酶没有二硫键,有152个氢键和29个盐键,酶的Glu190、Ala192和Asp215残基与一个Ca2+相结合,酶活性位点残基Asp44和Ser241溶剂可及表面积较大,分别达到0.2114 樻2和3.3093樻2;该酶的底物结合区域中,S1和S4口袋结构明显,S2次之,S3最不明显,部分组成S1和S4口袋的氨基酸残基不保守,这可能使该酶具有独特的水解性.上述结果可为该蛋白酶基因的异源表达和结构与功能关系等方面的研究提供参考.
利用 PCR和RACE(cDNA末耑快速擴增)技術從總狀毛黴中剋隆穫得1箇絲氨痠蛋白酶新基因,利用生物信息學方法對該基因序列、編碼的酶序列以及酶性質和結構進行預測.結果錶明:該基因編碼區序列長1421 bp ,由3箇外顯子和2箇內含子組成,編碼由429箇氨基痠殘基組成的多肽;對該多肽的組成和進化分析錶明,其成熟肽屬于蛋白酶K傢族的胞外蛋白酶;通過同源建模結構分析錶明,該酶沒有二硫鍵,有152箇氫鍵和29箇鹽鍵,酶的Glu190、Ala192和Asp215殘基與一箇Ca2+相結閤,酶活性位點殘基Asp44和Ser241溶劑可及錶麵積較大,分彆達到0.2114 樻2和3.3093樻2;該酶的底物結閤區域中,S1和S4口袋結構明顯,S2次之,S3最不明顯,部分組成S1和S4口袋的氨基痠殘基不保守,這可能使該酶具有獨特的水解性.上述結果可為該蛋白酶基因的異源錶達和結構與功能關繫等方麵的研究提供參攷.
이용 PCR화RACE(cDNA말단쾌속확증)기술종총상모매중극륭획득1개사안산단백매신기인,이용생물신식학방법대해기인서렬、편마적매서렬이급매성질화결구진행예측.결과표명:해기인편마구서렬장1421 bp ,유3개외현자화2개내함자조성,편마유429개안기산잔기조성적다태;대해다태적조성화진화분석표명,기성숙태속우단백매K가족적포외단백매;통과동원건모결구분석표명,해매몰유이류건,유152개경건화29개염건,매적Glu190、Ala192화Asp215잔기여일개Ca2+상결합,매활성위점잔기Asp44화Ser241용제가급표면적교대,분별체도0.2114 궤2화3.3093궤2;해매적저물결합구역중,S1화S4구대결구명현,S2차지,S3최불명현,부분조성S1화S4구대적안기산잔기불보수,저가능사해매구유독특적수해성.상술결과가위해단백매기인적이원표체화결구여공능관계등방면적연구제공삼고.
