作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2012年
11期
2034-2041
,共8页
乔麟轶**%张磊**%张文萍%赵光耀%王玺*%贾继增
喬麟軼**%張磊**%張文萍%趙光耀%王璽*%賈繼增
교린질**%장뢰**%장문평%조광요%왕새*%가계증
小麦%TaABP1-D基因%同源克隆%表达分析%功能标记%相关性分析
小麥%TaABP1-D基因%同源剋隆%錶達分析%功能標記%相關性分析
소맥%TaABP1-D기인%동원극륭%표체분석%공능표기%상관성분석
生长素在植物生长发育过程中通过建立浓度梯度来调控植物的株型.ABP1(auxin binding protein)作为生长素受体,在质膜上相关生长素响应活动中起重要作用.本研究从普通小麦中国春基因组数据库中分离了TaABP1基因的基因组序列,根据基因组间序列差异将 TaABP1定位于小麦第5同源群.在中国春中克隆得到 TaABP1-D基因的gDNA和cDNA序列.TaABP1-D基因的开放阅读框为1887 bp,编码205个氨基酸,含有ABP1蛋白典型的内质网滞留信号KDEL及Box区域.表达分析表明, TaABP1-D在普通小麦中国春拔节期的根、茎基部、茎上部和叶尖均有表达,相对表达量为叶尖>茎上部>根>茎基部,与小麦的株型发育关系密切.系统发育分析表明, ABP1基因在植物中较为保守, TaABP1-D是水稻OsABP1的直向同源基因.针对TaABP1-D基因上游调控区重复序列差异(GT)6/5开发了一个 SSR标记,该标记在 W7984×Opata85重组自交系(RIL)群体中对株高的表型变异解释率为9.7%,是一个与株高极显著关联的功能标记;其中对应高秆类型的等位变异属野生种特有,在栽培种中被淘汰,推测TaABP1-D基因在小麦驯化过程中可能经历了瓶颈效应.
生長素在植物生長髮育過程中通過建立濃度梯度來調控植物的株型.ABP1(auxin binding protein)作為生長素受體,在質膜上相關生長素響應活動中起重要作用.本研究從普通小麥中國春基因組數據庫中分離瞭TaABP1基因的基因組序列,根據基因組間序列差異將 TaABP1定位于小麥第5同源群.在中國春中剋隆得到 TaABP1-D基因的gDNA和cDNA序列.TaABP1-D基因的開放閱讀框為1887 bp,編碼205箇氨基痠,含有ABP1蛋白典型的內質網滯留信號KDEL及Box區域.錶達分析錶明, TaABP1-D在普通小麥中國春拔節期的根、莖基部、莖上部和葉尖均有錶達,相對錶達量為葉尖>莖上部>根>莖基部,與小麥的株型髮育關繫密切.繫統髮育分析錶明, ABP1基因在植物中較為保守, TaABP1-D是水稻OsABP1的直嚮同源基因.針對TaABP1-D基因上遊調控區重複序列差異(GT)6/5開髮瞭一箇 SSR標記,該標記在 W7984×Opata85重組自交繫(RIL)群體中對株高的錶型變異解釋率為9.7%,是一箇與株高極顯著關聯的功能標記;其中對應高稈類型的等位變異屬野生種特有,在栽培種中被淘汰,推測TaABP1-D基因在小麥馴化過程中可能經歷瞭瓶頸效應.
생장소재식물생장발육과정중통과건립농도제도래조공식물적주형.ABP1(auxin binding protein)작위생장소수체,재질막상상관생장소향응활동중기중요작용.본연구종보통소맥중국춘기인조수거고중분리료TaABP1기인적기인조서렬,근거기인조간서렬차이장 TaABP1정위우소맥제5동원군.재중국춘중극륭득도 TaABP1-D기인적gDNA화cDNA서렬.TaABP1-D기인적개방열독광위1887 bp,편마205개안기산,함유ABP1단백전형적내질망체류신호KDEL급Box구역.표체분석표명, TaABP1-D재보통소맥중국춘발절기적근、경기부、경상부화협첨균유표체,상대표체량위협첨>경상부>근>경기부,여소맥적주형발육관계밀절.계통발육분석표명, ABP1기인재식물중교위보수, TaABP1-D시수도OsABP1적직향동원기인.침대TaABP1-D기인상유조공구중복서렬차이(GT)6/5개발료일개 SSR표기,해표기재 W7984×Opata85중조자교계(RIL)군체중대주고적표형변이해석솔위9.7%,시일개여주고겁현저관련적공능표기;기중대응고간류형적등위변이속야생충특유,재재배충중피도태,추측TaABP1-D기인재소맥순화과정중가능경력료병경효응.