河南大学学报（自然科学版）
河南大學學報（自然科學版）
하남대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF HENAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2014年
1期
74-78
,共5页
泛素结合酶(E2)%角毛壳菌%克隆%生物信息学分析
汎素結閤酶(E2)%角毛殼菌%剋隆%生物信息學分析
범소결합매(E2)%각모각균%극륭%생물신식학분석
ubiquitin conjugating enzyme (E2)%Chaetomium cupreum%cloning%bioinformatics analysis
利用BlastX将角毛壳菌(Chaetomium cupreum)几丁质诱导的菌丝体cDNA文库中的ESTs序列与NCBI的Nr(Non-redundant)数据库进行相似性搜索,获得泛素结合酶(ubiquitin conjugating enzyme,E2)基因的ESTs.以此结果设计引物进行RT-PCR,克隆该基因的cDNA序列(CcE2).该序列长600 bp,开放阅读框444 bp,编码147个氨基酸组成的多肽,蛋白分子量为16.6 ku,是亲水性蛋白.BlastP分析表明该基因进化相当保守,与其他真菌的E2具有高度的相似性;三维结构分析显示CeE2仅包含一个功能结构域,在结构域的中央是决定CcE2活性的半胱氨酸残基活性位点.
利用BlastX將角毛殼菌(Chaetomium cupreum)幾丁質誘導的菌絲體cDNA文庫中的ESTs序列與NCBI的Nr(Non-redundant)數據庫進行相似性搜索,穫得汎素結閤酶(ubiquitin conjugating enzyme,E2)基因的ESTs.以此結果設計引物進行RT-PCR,剋隆該基因的cDNA序列(CcE2).該序列長600 bp,開放閱讀框444 bp,編碼147箇氨基痠組成的多肽,蛋白分子量為16.6 ku,是親水性蛋白.BlastP分析錶明該基因進化相噹保守,與其他真菌的E2具有高度的相似性;三維結構分析顯示CeE2僅包含一箇功能結構域,在結構域的中央是決定CcE2活性的半胱氨痠殘基活性位點.
이용BlastX장각모각균(Chaetomium cupreum)궤정질유도적균사체cDNA문고중적ESTs서렬여NCBI적Nr(Non-redundant)수거고진행상사성수색,획득범소결합매(ubiquitin conjugating enzyme,E2)기인적ESTs.이차결과설계인물진행RT-PCR,극륭해기인적cDNA서렬(CcE2).해서렬장600 bp,개방열독광444 bp,편마147개안기산조성적다태,단백분자량위16.6 ku,시친수성단백.BlastP분석표명해기인진화상당보수,여기타진균적E2구유고도적상사성;삼유결구분석현시CeE2부포함일개공능결구역,재결구역적중앙시결정CcE2활성적반광안산잔기활성위점.
