生物学杂志
生物學雜誌
생물학잡지
JOURNAL OF BIOLOGY
2014年
6期
89-93
,共5页
miR-21%靶基因%生物信息学%结肠癌
miR-21%靶基因%生物信息學%結腸癌
miR-21%파기인%생물신식학%결장암
miR-21%target genes%bioinformatics%colon cancer
为了利用生物信息学方法预测miR-21的靶基因及其功能,为后续研究miR-21及其靶基因在结肠癌发生中的作用机制奠定基础。研究通过miRBase获取并分析多个物种的miR-21的序列特征;应用TargetScan、PicTar, miRanda及miRecords 4种在线工具预测miR-21的靶基因,结合已证实的靶基因,对靶基因进行功能注释和信号通路富集分析;通过查找文献,综述miR-21的功能,结合功能注释和信号通路富集分析为进一步研究mir-21在结肠癌发生中的作用提供理论基础。
為瞭利用生物信息學方法預測miR-21的靶基因及其功能,為後續研究miR-21及其靶基因在結腸癌髮生中的作用機製奠定基礎。研究通過miRBase穫取併分析多箇物種的miR-21的序列特徵;應用TargetScan、PicTar, miRanda及miRecords 4種在線工具預測miR-21的靶基因,結閤已證實的靶基因,對靶基因進行功能註釋和信號通路富集分析;通過查找文獻,綜述miR-21的功能,結閤功能註釋和信號通路富集分析為進一步研究mir-21在結腸癌髮生中的作用提供理論基礎。
위료이용생물신식학방법예측miR-21적파기인급기공능,위후속연구miR-21급기파기인재결장암발생중적작용궤제전정기출。연구통과miRBase획취병분석다개물충적miR-21적서렬특정;응용TargetScan、PicTar, miRanda급miRecords 4충재선공구예측miR-21적파기인,결합이증실적파기인,대파기인진행공능주석화신호통로부집분석;통과사조문헌,종술miR-21적공능,결합공능주석화신호통로부집분석위진일보연구mir-21재결장암발생중적작용제공이론기출。
To predict miR-21 target genes and their functions through bioinformatic analysis and to establish the basis for the study of the mechanism of miR-21 and its target genes in colon cancer , miR-21 target genes were predicted by TargetScan , PicTar, miRanda and miRecords.Combined with validated target genes, the genes were analyzed by GO(gene ontology) and pathway enrichment.