昆明医科大学学报
昆明醫科大學學報
곤명의과대학학보
Journal of Kunming Medical University
2014年
11期
4-9
,共6页
陈波%者明伟%廖泽容%徐天勇%卢敏南%赵洪波
陳波%者明偉%廖澤容%徐天勇%盧敏南%趙洪波
진파%자명위%료택용%서천용%로민남%조홍파
hsa-miR-126%微小RNA%生物信息学%靶基因%功能
hsa-miR-126%微小RNA%生物信息學%靶基因%功能
hsa-miR-126%미소RNA%생물신식학%파기인%공능
hsa-miR-126%miRNA%Bioinformatics%Target genes%Function
目的 检测hsa-miR-126在各个组织器官中的表达情况,通过生物信息学预测hsa-miR-126的靶基因,进一步分析其可能功能,为研究hsa-miR-126的功能和机制奠定基础.方法 通过miRGator v3.0数据库查看hsa-miR-126在各个组织器官中的表达丰度情况;应用TargetScan、DIANA-microT-CDS及miRanda预测hsa-miR-126的靶基因;将预测所得靶基因和已证实的靶基因交集组成的基因集合分别进行功能富集分析(GO analysis)和信号转导通路富集分析,分析hsa-miR-126的可能功能.结果 hsa-miR-126在胃肠道,心脏,肾脏,肝胆系统,肺,干细胞,睾丸,胸腺,甲状腺,子宫中表达丰度较高;结合已被证实靶基因得到40个候选靶基因;靶基因主要参与细胞迁移调控以及腺体发育相关生物过程,涉及数个癌症通路和与癌症发生相关的信号通路,以及神经营养因子信号通路,ErbB信号通路,趋化因子信号通路和VEGF信号通路等.结论 hsa-miR-126预测的靶基因集合富集于多个生物学过程,与肿瘤和血管性疾病密切相关,生物信息预测结果为今后的研究奠定了基础.
目的 檢測hsa-miR-126在各箇組織器官中的錶達情況,通過生物信息學預測hsa-miR-126的靶基因,進一步分析其可能功能,為研究hsa-miR-126的功能和機製奠定基礎.方法 通過miRGator v3.0數據庫查看hsa-miR-126在各箇組織器官中的錶達豐度情況;應用TargetScan、DIANA-microT-CDS及miRanda預測hsa-miR-126的靶基因;將預測所得靶基因和已證實的靶基因交集組成的基因集閤分彆進行功能富集分析(GO analysis)和信號轉導通路富集分析,分析hsa-miR-126的可能功能.結果 hsa-miR-126在胃腸道,心髒,腎髒,肝膽繫統,肺,榦細胞,睪汍,胸腺,甲狀腺,子宮中錶達豐度較高;結閤已被證實靶基因得到40箇候選靶基因;靶基因主要參與細胞遷移調控以及腺體髮育相關生物過程,涉及數箇癌癥通路和與癌癥髮生相關的信號通路,以及神經營養因子信號通路,ErbB信號通路,趨化因子信號通路和VEGF信號通路等.結論 hsa-miR-126預測的靶基因集閤富集于多箇生物學過程,與腫瘤和血管性疾病密切相關,生物信息預測結果為今後的研究奠定瞭基礎.
목적 검측hsa-miR-126재각개조직기관중적표체정황,통과생물신식학예측hsa-miR-126적파기인,진일보분석기가능공능,위연구hsa-miR-126적공능화궤제전정기출.방법 통과miRGator v3.0수거고사간hsa-miR-126재각개조직기관중적표체봉도정황;응용TargetScan、DIANA-microT-CDS급miRanda예측hsa-miR-126적파기인;장예측소득파기인화이증실적파기인교집조성적기인집합분별진행공능부집분석(GO analysis)화신호전도통로부집분석,분석hsa-miR-126적가능공능.결과 hsa-miR-126재위장도,심장,신장,간담계통,폐,간세포,고환,흉선,갑상선,자궁중표체봉도교고;결합이피증실파기인득도40개후선파기인;파기인주요삼여세포천이조공이급선체발육상관생물과정,섭급수개암증통로화여암증발생상관적신호통로,이급신경영양인자신호통로,ErbB신호통로,추화인자신호통로화VEGF신호통로등.결론 hsa-miR-126예측적파기인집합부집우다개생물학과정,여종류화혈관성질병밀절상관,생물신식예측결과위금후적연구전정료기출.
