热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2014年
10期
2071-2077
,共7页
赵芹%谢大森%何晓明%罗少波%李明珠
趙芹%謝大森%何曉明%囉少波%李明珠
조근%사대삼%하효명%라소파%리명주
冬瓜%NBS%抗病同源序列%同源克隆%序列分析
鼕瓜%NBS%抗病同源序列%同源剋隆%序列分析
동과%NBS%항병동원서렬%동원극륭%서렬분석
Ax gourd%NBS%Resistance gene analogs%Homologous clone%Sequence analysis
以黑皮冬瓜“B98K”种质为试材,根据已克隆的植物NBS类抗病基因保守结构域设计简并引物,PCR扩增冬瓜基因组DNA,获得对应区段的DNA片段,回收克隆与测序后,得到19条抗病同源序列(命名为DNB1至DNB19).利用DNAStar软件进行序列分析及同源性比对发现,这些抗病同源序列长度在249～252 nt之间,其核苷酸序列同源性在48.4％～98.8％之间,氨基酸序列同源性为23.2％～100.0％,推导氨基酸序列具有P-loop(GGVGKTT)、Kinase-2a(VLDDVW)典型的NBS保守结构域.同源进化分析将其全部归为nonTIR-NBS-LRR类,与推导氨基酸序列多重比较结果一致;该序列与其他作物已克隆抗病基因的氨基酸序列同源性在24.7 ％～99.0％之间.该组序列已登录Genbank,登录号为KF776401～KF776419.
以黑皮鼕瓜“B98K”種質為試材,根據已剋隆的植物NBS類抗病基因保守結構域設計簡併引物,PCR擴增鼕瓜基因組DNA,穫得對應區段的DNA片段,迴收剋隆與測序後,得到19條抗病同源序列(命名為DNB1至DNB19).利用DNAStar軟件進行序列分析及同源性比對髮現,這些抗病同源序列長度在249～252 nt之間,其覈苷痠序列同源性在48.4％～98.8％之間,氨基痠序列同源性為23.2％～100.0％,推導氨基痠序列具有P-loop(GGVGKTT)、Kinase-2a(VLDDVW)典型的NBS保守結構域.同源進化分析將其全部歸為nonTIR-NBS-LRR類,與推導氨基痠序列多重比較結果一緻;該序列與其他作物已剋隆抗病基因的氨基痠序列同源性在24.7 ％～99.0％之間.該組序列已登錄Genbank,登錄號為KF776401～KF776419.
이흑피동과“B98K”충질위시재,근거이극륭적식물NBS류항병기인보수결구역설계간병인물,PCR확증동과기인조DNA,획득대응구단적DNA편단,회수극륭여측서후,득도19조항병동원서렬(명명위DNB1지DNB19).이용DNAStar연건진행서렬분석급동원성비대발현,저사항병동원서렬장도재249～252 nt지간,기핵감산서렬동원성재48.4％～98.8％지간,안기산서렬동원성위23.2％～100.0％,추도안기산서렬구유P-loop(GGVGKTT)、Kinase-2a(VLDDVW)전형적NBS보수결구역.동원진화분석장기전부귀위nonTIR-NBS-LRR류,여추도안기산서렬다중비교결과일치;해서렬여기타작물이극륭항병기인적안기산서렬동원성재24.7 ％～99.0％지간.해조서렬이등록Genbank,등록호위KF776401～KF776419.
