安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
34期
12132-12136
,共5页
赵慧%王遂%刘笑平%林永红%王松波%宋双林%李开隆
趙慧%王遂%劉笑平%林永紅%王鬆波%宋雙林%李開隆
조혜%왕수%류소평%림영홍%왕송파%송쌍림%리개륭
杨树%木葡聚糖内糖基转移酶%生物信息学
楊樹%木葡聚糖內糖基轉移酶%生物信息學
양수%목포취당내당기전이매%생물신식학
Populus alba × Populus tremula var. glandulosa%Xyloglucan endotransglycosylase%Bioinformatics
[目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础.[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测.[结果]该基因编码290个氨基酸残基,相对分子质量33 672.0 D,理论等电点(pI)7.04;该酶可能存在3个卷曲结构部位、1个信号肽剪切位点和1个跨膜区,是典型的分泌蛋白;三级结构同源建模预测结果较好,二级结构预测中的螺旋、卷曲和折叠均可见.相似性比对和进化分析显示其与葡萄等的序列相似度较高;而蛋白质三级结构的预测则发现,该酶与几种杆菌的蛋白较接近.[结论]XET基因可能在很多生物中具有较高的保守性.
[目的]通過生物信息學方法對雜種楊樹木葡聚糖內糖基轉移酶基因的DNA序列、蛋白質序列進行分析預測,為進一步研究奠定基礎.[方法]以XET基因及其氨基痠序列為研究對象,利用多種網絡數據庫及生物信息學軟件對其進行分析預測.[結果]該基因編碼290箇氨基痠殘基,相對分子質量33 672.0 D,理論等電點(pI)7.04;該酶可能存在3箇捲麯結構部位、1箇信號肽剪切位點和1箇跨膜區,是典型的分泌蛋白;三級結構同源建模預測結果較好,二級結構預測中的螺鏇、捲麯和摺疊均可見.相似性比對和進化分析顯示其與葡萄等的序列相似度較高;而蛋白質三級結構的預測則髮現,該酶與幾種桿菌的蛋白較接近.[結論]XET基因可能在很多生物中具有較高的保守性.
[목적]통과생물신식학방법대잡충양수목포취당내당기전이매기인적DNA서렬、단백질서렬진행분석예측,위진일보연구전정기출.[방법]이XET기인급기안기산서렬위연구대상,이용다충망락수거고급생물신식학연건대기진행분석예측.[결과]해기인편마290개안기산잔기,상대분자질량33 672.0 D,이론등전점(pI)7.04;해매가능존재3개권곡결구부위、1개신호태전절위점화1개과막구,시전형적분비단백;삼급결구동원건모예측결과교호,이급결구예측중적라선、권곡화절첩균가견.상사성비대화진화분석현시기여포도등적서렬상사도교고;이단백질삼급결구적예측칙발현,해매여궤충간균적단백교접근.[결론]XET기인가능재흔다생물중구유교고적보수성.
