野生动物学报
野生動物學報
야생동물학보
Chinese Journal of Wildlife
2014年
4期
407-413
,共7页
钟源%潘阳%侯文海%姚永芳%徐怀亮%张栓玲
鐘源%潘暘%侯文海%姚永芳%徐懷亮%張栓玲
종원%반양%후문해%요영방%서부량%장전령
黑熊%苦味受体%Tas2R2基因%克隆%分子进化分析
黑熊%苦味受體%Tas2R2基因%剋隆%分子進化分析
흑웅%고미수체%Tas2R2기인%극륭%분자진화분석
实验采用PCR和克隆测序方法首次从黑熊基因组中获得一全长为1019 bp的苦味受体Tas2R2基因DNA序列(GenBank登录号:JQ239035).该序列含有完整的1个外显子(无内含子),大小为915 bp,编码304个氨基酸残基.其蛋白质等电点为9.49,分子量为34.80 kDa.拓扑结构预测显示黑熊Tas2R2蛋白上含有3个N糖基化位点、4个丝氨酸磷酸化位点、3个色氨酸磷酸化位点和1个酪氨酸磷酸化位点.整个蛋白质多肽链含有7个跨膜螺旋区,细胞外区和内区均为4个.亲水性/疏水性分析表明,黑熊Tas2 R2蛋白质为疏水性蛋白,其亲水性区段所占比例较小.种间同源性比较显示,黑熊Tas2R2基因与大熊猫、猫、犬、马和小鼠的cDNA序列同源性分别为98.3%、91.5%、62.9%、58.7%、52.6%;氨基酸序列同源性分别为96.7%、85.5%、49.3%、44.7%、36.1%.黑熊、大熊猫、犬、猫、马和小鼠的Tas2R2基因外显子核苷酸序列构建的基因树与其物种树的拓扑结构是相一致的,表明Tas2R2基因适合于构建不同物种间的系统进化树.
實驗採用PCR和剋隆測序方法首次從黑熊基因組中穫得一全長為1019 bp的苦味受體Tas2R2基因DNA序列(GenBank登錄號:JQ239035).該序列含有完整的1箇外顯子(無內含子),大小為915 bp,編碼304箇氨基痠殘基.其蛋白質等電點為9.49,分子量為34.80 kDa.拓撲結構預測顯示黑熊Tas2R2蛋白上含有3箇N糖基化位點、4箇絲氨痠燐痠化位點、3箇色氨痠燐痠化位點和1箇酪氨痠燐痠化位點.整箇蛋白質多肽鏈含有7箇跨膜螺鏇區,細胞外區和內區均為4箇.親水性/疏水性分析錶明,黑熊Tas2 R2蛋白質為疏水性蛋白,其親水性區段所佔比例較小.種間同源性比較顯示,黑熊Tas2R2基因與大熊貓、貓、犬、馬和小鼠的cDNA序列同源性分彆為98.3%、91.5%、62.9%、58.7%、52.6%;氨基痠序列同源性分彆為96.7%、85.5%、49.3%、44.7%、36.1%.黑熊、大熊貓、犬、貓、馬和小鼠的Tas2R2基因外顯子覈苷痠序列構建的基因樹與其物種樹的拓撲結構是相一緻的,錶明Tas2R2基因適閤于構建不同物種間的繫統進化樹.
실험채용PCR화극륭측서방법수차종흑웅기인조중획득일전장위1019 bp적고미수체Tas2R2기인DNA서렬(GenBank등록호:JQ239035).해서렬함유완정적1개외현자(무내함자),대소위915 bp,편마304개안기산잔기.기단백질등전점위9.49,분자량위34.80 kDa.탁복결구예측현시흑웅Tas2R2단백상함유3개N당기화위점、4개사안산린산화위점、3개색안산린산화위점화1개락안산린산화위점.정개단백질다태련함유7개과막라선구,세포외구화내구균위4개.친수성/소수성분석표명,흑웅Tas2 R2단백질위소수성단백,기친수성구단소점비례교소.충간동원성비교현시,흑웅Tas2R2기인여대웅묘、묘、견、마화소서적cDNA서렬동원성분별위98.3%、91.5%、62.9%、58.7%、52.6%;안기산서렬동원성분별위96.7%、85.5%、49.3%、44.7%、36.1%.흑웅、대웅묘、견、묘、마화소서적Tas2R2기인외현자핵감산서렬구건적기인수여기물충수적탁복결구시상일치적,표명Tas2R2기인괄합우구건불동물충간적계통진화수.