微生物学杂志
微生物學雜誌
미생물학잡지
JOURNAL OF MICROBIOLOGY
2014年
5期
8-12
,共5页
元基因组%海洋%细菌%古生菌%真核生物
元基因組%海洋%細菌%古生菌%真覈生物
원기인조%해양%세균%고생균%진핵생물
metagenome%ocean%bacteria%archaea%eukaryote
通过对海洋13个样品元基因组数据的BLAST搜索,筛选到了16S rRNA基因序列1 600条,18SrRNA基因序列61条.分类结果显示,细菌在海岸、公开海域深层海水和表层海水3种海洋环境类型中都占优势,其相对百分比分别为98%、59%和91%.相比于海岸和公开海域表层海水,公开海域深层海水中古生菌和Deltaproteobacteria所占的相对含量较高,各31%和27%.海岸检测到的古生菌主要为Euryarcheata,公开海域深层海水检测到的古生菌主要为Crenarchaeota(93%为与氨氧化相关的MGI纲).结果表明,氨氧化相关古生菌在深海生态系统中的作用可能较大.
通過對海洋13箇樣品元基因組數據的BLAST搜索,篩選到瞭16S rRNA基因序列1 600條,18SrRNA基因序列61條.分類結果顯示,細菌在海岸、公開海域深層海水和錶層海水3種海洋環境類型中都佔優勢,其相對百分比分彆為98%、59%和91%.相比于海岸和公開海域錶層海水,公開海域深層海水中古生菌和Deltaproteobacteria所佔的相對含量較高,各31%和27%.海岸檢測到的古生菌主要為Euryarcheata,公開海域深層海水檢測到的古生菌主要為Crenarchaeota(93%為與氨氧化相關的MGI綱).結果錶明,氨氧化相關古生菌在深海生態繫統中的作用可能較大.
통과대해양13개양품원기인조수거적BLAST수색,사선도료16S rRNA기인서렬1 600조,18SrRNA기인서렬61조.분류결과현시,세균재해안、공개해역심층해수화표층해수3충해양배경류형중도점우세,기상대백분비분별위98%、59%화91%.상비우해안화공개해역표층해수,공개해역심층해수중고생균화Deltaproteobacteria소점적상대함량교고,각31%화27%.해안검측도적고생균주요위Euryarcheata,공개해역심층해수검측도적고생균주요위Crenarchaeota(93%위여안양화상관적MGI강).결과표명,안양화상관고생균재심해생태계통중적작용가능교대.