控制工程
控製工程
공제공정
CONTROL ENGINEERING OF CHINA
2014年
6期
896-899,903
,共5页
潘多涛%史洪岩%黄明忠%袁德成
潘多濤%史洪巖%黃明忠%袁德成
반다도%사홍암%황명충%원덕성
系统生物学%代谢途径%糖酵解%计算机仿真%非线性规划
繫統生物學%代謝途徑%糖酵解%計算機倣真%非線性規劃
계통생물학%대사도경%당효해%계산궤방진%비선성규화
system biology%metabolic pathway%glycolysis%simulation%nonlinear programming
随着系统生物学研究的不断深入,生物过程网络的规模逐步拓展,其模型的复杂程度也越来越高,数值积分等常规方法很难求解生物代谢网络这类大规模复杂动态系统,客观上需要新的分析方法去应对.针对典型的酿酒酵母糖酵解途径的动态模型,首先利用Matlab进行常规的数值积分求解,以此作为参照,提出将糖酵解的动态模型离散化后利用非线性规划解题器IPOPT进行动态仿真的思路,采用不同的离散步长,计算得到不同的仿真结果.计算结果显示,通过调整计算参数,IPOPT可得到与参照一致的仿真结果,这表明非线性规划可作为分析优化生物过程这类大规模复杂动态系统的新方法,为下一步进行模型参数估计、多目标动态优化等打下基础.
隨著繫統生物學研究的不斷深入,生物過程網絡的規模逐步拓展,其模型的複雜程度也越來越高,數值積分等常規方法很難求解生物代謝網絡這類大規模複雜動態繫統,客觀上需要新的分析方法去應對.針對典型的釀酒酵母糖酵解途徑的動態模型,首先利用Matlab進行常規的數值積分求解,以此作為參照,提齣將糖酵解的動態模型離散化後利用非線性規劃解題器IPOPT進行動態倣真的思路,採用不同的離散步長,計算得到不同的倣真結果.計算結果顯示,通過調整計算參數,IPOPT可得到與參照一緻的倣真結果,這錶明非線性規劃可作為分析優化生物過程這類大規模複雜動態繫統的新方法,為下一步進行模型參數估計、多目標動態優化等打下基礎.
수착계통생물학연구적불단심입,생물과정망락적규모축보탁전,기모형적복잡정도야월래월고,수치적분등상규방법흔난구해생물대사망락저류대규모복잡동태계통,객관상수요신적분석방법거응대.침대전형적양주효모당효해도경적동태모형,수선이용Matlab진행상규적수치적분구해,이차작위삼조,제출장당효해적동태모형리산화후이용비선성규화해제기IPOPT진행동태방진적사로,채용불동적리산보장,계산득도불동적방진결과.계산결과현시,통과조정계산삼수,IPOPT가득도여삼조일치적방진결과,저표명비선성규화가작위분석우화생물과정저류대규모복잡동태계통적신방법,위하일보진행모형삼수고계、다목표동태우화등타하기출.
