安徽医科大学学报
安徽醫科大學學報
안휘의과대학학보
ACTA UNIVERSITY MEDICINALIS ANHUI
2014年
11期
1534-1538
,共5页
孔薇%张敬茂%牟晓阳%杨旸
孔薇%張敬茂%牟曉暘%楊旸
공미%장경무%모효양%양양
阿尔茨海默症%基因表达数据%蛋白质交互作用%信号传导通路%炎症反应
阿爾茨海默癥%基因錶達數據%蛋白質交互作用%信號傳導通路%炎癥反應
아이자해묵증%기인표체수거%단백질교호작용%신호전도통로%염증반응
Alzheimer's disease%gene expression data%protein-protein interaction%pathway%inflammation
目的 融合基因表达数据和蛋白质交互作用数据(PPI),同时考虑到炎症反应是阿尔茨海默症(AD)核心病理机制之一,构建基于炎症因子核因子-κB (NF-κB)的AD相关信号传导通路.方法 首先,使用线性回归模型进行显著基因提取;然后,使用整数线性规划方法(ILP)融合基因表达数据和PPI数据,构建信号传导通路.结果 得到以NF-κB为起点的预测通路,通路中包含6个已确定的AD致病基因,并探寻出与AD密切相关的T/B细胞受体信号通路,发现多个与炎症相关的基因.结论 证明炎症反应是AD产生和发展的重要因素之一.
目的 融閤基因錶達數據和蛋白質交互作用數據(PPI),同時攷慮到炎癥反應是阿爾茨海默癥(AD)覈心病理機製之一,構建基于炎癥因子覈因子-κB (NF-κB)的AD相關信號傳導通路.方法 首先,使用線性迴歸模型進行顯著基因提取;然後,使用整數線性規劃方法(ILP)融閤基因錶達數據和PPI數據,構建信號傳導通路.結果 得到以NF-κB為起點的預測通路,通路中包含6箇已確定的AD緻病基因,併探尋齣與AD密切相關的T/B細胞受體信號通路,髮現多箇與炎癥相關的基因.結論 證明炎癥反應是AD產生和髮展的重要因素之一.
목적 융합기인표체수거화단백질교호작용수거(PPI),동시고필도염증반응시아이자해묵증(AD)핵심병리궤제지일,구건기우염증인자핵인자-κB (NF-κB)적AD상관신호전도통로.방법 수선,사용선성회귀모형진행현저기인제취;연후,사용정수선성규화방법(ILP)융합기인표체수거화PPI수거,구건신호전도통로.결과 득도이NF-κB위기점적예측통로,통로중포함6개이학정적AD치병기인,병탐심출여AD밀절상관적T/B세포수체신호통로,발현다개여염증상관적기인.결론 증명염증반응시AD산생화발전적중요인소지일.
