微生物与感染
微生物與感染
미생물여감염
JOURNAL OF MICROBES AND INFECTION
2014年
4期
224-229
,共6页
李蒙%孙桂芹%陈菁%李天胜%王蕾%策力木格%陈力
李矇%孫桂芹%陳菁%李天勝%王蕾%策力木格%陳力
리몽%손계근%진정%리천성%왕뢰%책력목격%진력
脑膜炎败血伊丽莎白金菌%聚合酶链反应%N-糖苷酶F%N-糖苷酶F-Ⅱ
腦膜炎敗血伊麗莎白金菌%聚閤酶鏈反應%N-糖苷酶F%N-糖苷酶F-Ⅱ
뇌막염패혈이려사백금균%취합매련반응%N-당감매F%N-당감매F-Ⅱ
Elizabethkingia meningosepticum%Polymerase chain reaction%Peptide:N-glycanase F%Peptide:N-glycanase F-Ⅱ
N‐糖苷酶(PNGase)是真核生物中的常见酶,但在原核生物中极为罕见,目前仅报道在脑膜炎败血伊丽莎白金菌(EM)中存在。本文旨在检测 PNGase基因在EM临床分离株中的分布,为该菌的亚型分类及快速核酸分子检测提供依据,为研究PNGase在原核生物中的生物学功能奠定基础。于2010年7月~2012年12月收集浙江省3家三级甲等医院的65株EM临床分离株,提取细菌基因组 DNA ,利用16 S rRNA细菌通用引物、PNGase F和PNGase F‐Ⅱ特异性引物,进行组合聚合酶链反应(PCR)。阳性扩增产物测序后与美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中已知EM序列比对确认。结果显示,PNGase阳性菌64株,总阳性率为98.5%;PNGase F和PNGase F‐Ⅱ共阳性菌39株,共阳性率为60.0%。 PNGase F阳性菌41株,阳性率为63.1%;PNGase F‐Ⅱ阳性菌62株,阳性率为95.4%,PNGase F‐Ⅱ阳性率高于 PNGase F (配对χ2检验, P<0.01),提示 PNGase可能对EM具有重要的生物学意义。结果还表明,本研究建立的组合PCR可应用于E M菌株中 PN G ase基因分型。
N‐糖苷酶(PNGase)是真覈生物中的常見酶,但在原覈生物中極為罕見,目前僅報道在腦膜炎敗血伊麗莎白金菌(EM)中存在。本文旨在檢測 PNGase基因在EM臨床分離株中的分佈,為該菌的亞型分類及快速覈痠分子檢測提供依據,為研究PNGase在原覈生物中的生物學功能奠定基礎。于2010年7月~2012年12月收集浙江省3傢三級甲等醫院的65株EM臨床分離株,提取細菌基因組 DNA ,利用16 S rRNA細菌通用引物、PNGase F和PNGase F‐Ⅱ特異性引物,進行組閤聚閤酶鏈反應(PCR)。暘性擴增產物測序後與美國國立生物技術信息中心(NCBI)數據庫中已知EM序列比對確認。結果顯示,PNGase暘性菌64株,總暘性率為98.5%;PNGase F和PNGase F‐Ⅱ共暘性菌39株,共暘性率為60.0%。 PNGase F暘性菌41株,暘性率為63.1%;PNGase F‐Ⅱ暘性菌62株,暘性率為95.4%,PNGase F‐Ⅱ暘性率高于 PNGase F (配對χ2檢驗, P<0.01),提示 PNGase可能對EM具有重要的生物學意義。結果還錶明,本研究建立的組閤PCR可應用于E M菌株中 PN G ase基因分型。
N‐당감매(PNGase)시진핵생물중적상견매,단재원핵생물중겁위한견,목전부보도재뇌막염패혈이려사백금균(EM)중존재。본문지재검측 PNGase기인재EM림상분리주중적분포,위해균적아형분류급쾌속핵산분자검측제공의거,위연구PNGase재원핵생물중적생물학공능전정기출。우2010년7월~2012년12월수집절강성3가삼급갑등의원적65주EM림상분리주,제취세균기인조 DNA ,이용16 S rRNA세균통용인물、PNGase F화PNGase F‐Ⅱ특이성인물,진행조합취합매련반응(PCR)。양성확증산물측서후여미국국립생물기술신식중심(NCBI)수거고중이지EM서렬비대학인。결과현시,PNGase양성균64주,총양성솔위98.5%;PNGase F화PNGase F‐Ⅱ공양성균39주,공양성솔위60.0%。 PNGase F양성균41주,양성솔위63.1%;PNGase F‐Ⅱ양성균62주,양성솔위95.4%,PNGase F‐Ⅱ양성솔고우 PNGase F (배대χ2검험, P<0.01),제시 PNGase가능대EM구유중요적생물학의의。결과환표명,본연구건립적조합PCR가응용우E M균주중 PN G ase기인분형。
The present paper aims to investigate the distribution of two peptide :N‐glycanase (PNGase) genes in Elizabethkingia meningosepticum (EM ) . The genomic DNAs of 65 clinical strains isolated from 3 hospitals in Zhejiang Province were extracted and subjected to polymerase chain reaction (PCR ) for 16 S rRNA , PNGase F and PNGase F‐Ⅱ genes respectively .The PCR products were sequenced and compared to the known sequences in National Center of Biotechnology Information (NCBI) .The results showed that the positive rate of PNGase gene was 98 .5% and the PNGase F/PNGase F‐Ⅱ gene co‐existence rate was 60 .0% .The positive rates of PNGase F gene and PNGase F‐Ⅱ gene were 63 .1% and 95 .4% ,respectively (matching χ2 test , P<0 .01) .The results indicate that the developed PCR can be used to detect PNGase gene in EM strains and PNGase activity may be crucial for the survival .