CAJ | 학술논문

旨在通过对灵芝基因组SSR位点的统计分析,为担子菌基因组的特征描述、遗传分析及分子标记的筛选提供基础信息.基于数据库中灵芝基因组数据,通过SSR Hunter 1.3软件并结合人工查找的方式分析其SSR数量、组成和位点分布等情况.结果表明:灵芝基因组序列总长度为4.19×107bp,13条染色体共存在3 502个SSR位点,SSR碱基总长度为6.92×104 bp,占基因组总数的0.17％,平均每隔11.96 kb存在1个SSR位点,三碱基和六碱基SSR所占比例最大,占基因组内SSR位点总数的74.62％,出现较多的基序为(G)n、(C)n、(GA)n、(CT)n、(GAC)n、(TCG)n、(TAATC)n和(GATGAG)n;三核苷酸、五核苷酸和六核苷酸SSR在染色体水平上分布较均匀,而单核苷酸、二核苷酸和四核苷酸SSR分布差异较大.灵芝基因组内SSR分布呈现一定的规律性,基于基因组数据发掘的SSR位点能够为SSR分子标记的开发提供信息,并有助于灵芝高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能的研究等.
지재통과대령지기인조SSR위점적통계분석,위담자균기인조적특정묘술、유전분석급분자표기적사선제공기출신식.기우수거고중령지기인조수거,통과SSR Hunter 1.3연건병결합인공사조적방식분석기SSR수량、조성화위점분포등정황.결과표명:령지기인조서렬총장도위4.19×107bp,13조염색체공존재3 502개SSR위점,SSR감기총장도위6.92×104 bp,점기인조총수적0.17％,평균매격11.96 kb존재1개SSR위점,삼감기화륙감기SSR소점비례최대,점기인조내SSR위점총수적74.62％,출현교다적기서위(G)n、(C)n、(GA)n、(CT)n、(GAC)n、(TCG)n、(TAATC)n화(GATGAG)n;삼핵감산、오핵감산화륙핵감산SSR재염색체수평상분포교균균,이단핵감산、이핵감산화사핵감산SSR분포차이교대.령지기인조내SSR분포정현일정적규률성,기우기인조수거발굴적SSR위점능구위SSR분자표기적개발제공신식,병유조우령지고밀도유전도보적구건、중요공능기인극륭급기인공능적연구등.