江苏农业学报
江囌農業學報
강소농업학보
JIANGSU JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
6期
1267-1272
,共6页
葛敏%吕远大%张体付%李坦%张晓林%赵涵
葛敏%呂遠大%張體付%李坦%張曉林%趙涵
갈민%려원대%장체부%리탄%장효림%조함
玉米%YABBY%转录因子%表达谱
玉米%YABBY%轉錄因子%錶達譜
옥미%YABBY%전록인자%표체보
maize%YABBY%transcription factor%expression profi1ing
YABBY基因家族作为植物特有的转录因子家族,在调控植物侧生器官发育中发挥重要作用.本研究利用玉米全基因组数据分析玉米YABBY基因家族,阐明该基因家族成员结构、系统进化发育关系以及基因家族成员在玉米不同组织及不同发育时期的表达谱.结果显示,玉米参考基因组中存在13个YABBY基因,命名为ZmY-ABBY1~ZmYABBY13,根据系统发育关系和序列相似性将该基因家族分为4亚类S1~S4. RNAseq数据显示玉米YABBY基因在籽粒、茎和茎端分生组织( Shoot apica1 meristem,SAM)、幼胚及叶片中有较高表达,预示玉米YABBY基因可能在上述器官发育中发挥调控作用.本研究结果为进一步解析该基因家族的功能奠定了研究基础.
YABBY基因傢族作為植物特有的轉錄因子傢族,在調控植物側生器官髮育中髮揮重要作用.本研究利用玉米全基因組數據分析玉米YABBY基因傢族,闡明該基因傢族成員結構、繫統進化髮育關繫以及基因傢族成員在玉米不同組織及不同髮育時期的錶達譜.結果顯示,玉米參攷基因組中存在13箇YABBY基因,命名為ZmY-ABBY1~ZmYABBY13,根據繫統髮育關繫和序列相似性將該基因傢族分為4亞類S1~S4. RNAseq數據顯示玉米YABBY基因在籽粒、莖和莖耑分生組織( Shoot apica1 meristem,SAM)、幼胚及葉片中有較高錶達,預示玉米YABBY基因可能在上述器官髮育中髮揮調控作用.本研究結果為進一步解析該基因傢族的功能奠定瞭研究基礎.
YABBY기인가족작위식물특유적전록인자가족,재조공식물측생기관발육중발휘중요작용.본연구이용옥미전기인조수거분석옥미YABBY기인가족,천명해기인가족성원결구、계통진화발육관계이급기인가족성원재옥미불동조직급불동발육시기적표체보.결과현시,옥미삼고기인조중존재13개YABBY기인,명명위ZmY-ABBY1~ZmYABBY13,근거계통발육관계화서렬상사성장해기인가족분위4아류S1~S4. RNAseq수거현시옥미YABBY기인재자립、경화경단분생조직( Shoot apica1 meristem,SAM)、유배급협편중유교고표체,예시옥미YABBY기인가능재상술기관발육중발휘조공작용.본연구결과위진일보해석해기인가족적공능전정료연구기출.
YABBY gene fami1y, as a group of p1ant-specific transcription factors, is invo1ved in the deve1opment of 1atera1 organs in p1ants. Based on maize V3 genome sequence, a genome-wide overview of gene fami1y in maize was presen-ted, inc1uding the gene structures, phy1ogeny, and mRNA expression at1as in 18 different deve1opment stages. The ana1y-ses have revea1ed 13 YABBY genes existing in maize genome, named ZmYABBY1-ZmYABBY13. According to the phy1oge-netic re1ationships and sequence simi1arity, the gene fami1y was divided into 4 subgroups (S1-S4). YABBY gene expres-sion profi1ing ana1ysis showed that some genes were high1y expressed in deve1oping seed, stem and shoot apica1 meristem ( SAM) , embryo and 1eaf, suggesting YABBY genes may p1ay an positive ro1e in the deve1opment of these tissues. The pre-1iminary genomics ana1ysis 1ays a foundation for future functiona1 dissection of YABBY fami1y gene.