计算机与现代化
計算機與現代化
계산궤여현대화
COMPUTER AND MODERNIZATION
2014年
12期
11-14
,共4页
PA指标%双聚类%GO分析%微阵列基因数据
PA指標%雙聚類%GO分析%微陣列基因數據
PA지표%쌍취류%GO분석%미진렬기인수거
PA index%biclustering%GO analysis%microarray gene expression data
针对目前双聚类算法很少考虑所得聚类结果整体的划分质量问题,提出一种基于PA指标的双聚类算法。该算法选定一种衡量所有簇划分效果的PA指标来构造双聚类的模型,运用启发式贪心策略,通过迭代增删行列的方式挖掘出划分效果较高的几个双聚类。将所提算法与CC、FLOC算法进行算法性能的比较。实验结果表明,该算法能获得更好的结果。这说明该算法更能挖掘出具备既有统计意义又有生物意义的局部模式。
針對目前雙聚類算法很少攷慮所得聚類結果整體的劃分質量問題,提齣一種基于PA指標的雙聚類算法。該算法選定一種衡量所有簇劃分效果的PA指標來構造雙聚類的模型,運用啟髮式貪心策略,通過迭代增刪行列的方式挖掘齣劃分效果較高的幾箇雙聚類。將所提算法與CC、FLOC算法進行算法性能的比較。實驗結果錶明,該算法能穫得更好的結果。這說明該算法更能挖掘齣具備既有統計意義又有生物意義的跼部模式。
침대목전쌍취류산법흔소고필소득취류결과정체적화분질량문제,제출일충기우PA지표적쌍취류산법。해산법선정일충형량소유족화분효과적PA지표래구조쌍취류적모형,운용계발식탐심책략,통과질대증산행렬적방식알굴출화분효과교고적궤개쌍취류。장소제산법여CC、FLOC산법진행산법성능적비교。실험결과표명,해산법능획득경호적결과。저설명해산법경능알굴출구비기유통계의의우유생물의의적국부모식。
To improve the global quality of the outcome of the biclustering , a biclustering algorithm based on PA index was pro-posed .In this algorithm , the PA index which can estimate the effect of outcome of the biclustering was chosen to construct the bi -cluster model.Through deleting or inserting rows and columns in the heuristic greedy fashion , the algorithm obtained the signifi-cant biclusters of high global quality .To compare the performance of the algorithm with CC and FLOC , a real dataset experiment was simulated.The result shows that the algorithm in this paper can obtain better results .In a word, the algorithm is capable of detecting potentially statistically and biologically significant biclusters .