肝胆胰外科杂志
肝膽胰外科雜誌
간담이외과잡지
JOURNAL OF HEPATOPANCREATOBILIARY SURGERY
2014年
6期
466-470
,共5页
肝细胞肿瘤(HCC)%共表达网络%术后复发%分子标记物
肝細胞腫瘤(HCC)%共錶達網絡%術後複髮%分子標記物
간세포종류(HCC)%공표체망락%술후복발%분자표기물
hepatocellular carcinoma (HCC)%co-expression network%postoperative recurrence%biomarker
目的 结合肝细胞肿瘤(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的表达谱数据和基因共表达网络分析,寻找HCC术后复发相关的分子标记物.方法 筛选35/41例术后复发/未复发患者的表达谱数据的差异表达基因,然后建立基因共表达网络;利用MCODE软件寻找网络中基因共表达模块以及核心基因;最后,利用三种交叉验证方法[留一交叉验证(LOOCV)、十折交叉验证(10 fold CV)以及蒙特卡罗交叉验证(MCCV)]证明核心基因的分类能力.结果 差异表达基因筛选得到316个差异基因,共表达网络分析得到了包括84个基因的网络,MCODE软件分析得到两个基因模块及其核心基因:RACGAP1和ETS2.三种交叉验证实验发现,这两个基因对HCC样本的分类结果,LOOCV:87％(86％ ～ 89％)、10 fold CV:88％(87％ ～89％),MCCV:85％(85％ ～86％).结论 以上结果提示,RACGAP1和ETS2基因可作为HCC术后复发的分子标记物.
目的 結閤肝細胞腫瘤(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的錶達譜數據和基因共錶達網絡分析,尋找HCC術後複髮相關的分子標記物.方法 篩選35/41例術後複髮/未複髮患者的錶達譜數據的差異錶達基因,然後建立基因共錶達網絡;利用MCODE軟件尋找網絡中基因共錶達模塊以及覈心基因;最後,利用三種交扠驗證方法[留一交扠驗證(LOOCV)、十摺交扠驗證(10 fold CV)以及矇特卡囉交扠驗證(MCCV)]證明覈心基因的分類能力.結果 差異錶達基因篩選得到316箇差異基因,共錶達網絡分析得到瞭包括84箇基因的網絡,MCODE軟件分析得到兩箇基因模塊及其覈心基因:RACGAP1和ETS2.三種交扠驗證實驗髮現,這兩箇基因對HCC樣本的分類結果,LOOCV:87％(86％ ～ 89％)、10 fold CV:88％(87％ ～89％),MCCV:85％(85％ ～86％).結論 以上結果提示,RACGAP1和ETS2基因可作為HCC術後複髮的分子標記物.
목적 결합간세포종류(hepatocellular carcinoma,HCC)환자적표체보수거화기인공표체망락분석,심조HCC술후복발상관적분자표기물.방법 사선35/41례술후복발/미복발환자적표체보수거적차이표체기인,연후건립기인공표체망락;이용MCODE연건심조망락중기인공표체모괴이급핵심기인;최후,이용삼충교차험증방법[류일교차험증(LOOCV)、십절교차험증(10 fold CV)이급몽특잡라교차험증(MCCV)]증명핵심기인적분류능력.결과 차이표체기인사선득도316개차이기인,공표체망락분석득도료포괄84개기인적망락,MCODE연건분석득도량개기인모괴급기핵심기인:RACGAP1화ETS2.삼충교차험증실험발현,저량개기인대HCC양본적분류결과,LOOCV:87％(86％ ～ 89％)、10 fold CV:88％(87％ ～89％),MCCV:85％(85％ ～86％).결론 이상결과제시,RACGAP1화ETS2기인가작위HCC술후복발적분자표기물.
