实用癌症杂志
實用癌癥雜誌
실용암증잡지
THE PRACTICAL JOURNAL OF CANCER
2014年
12期
1548-1552
,共5页
全基因组关联研究%文献研究%数据挖掘
全基因組關聯研究%文獻研究%數據挖掘
전기인조관련연구%문헌연구%수거알굴
Genome-wide Association Study ( GWAS)%Literature research%Data Mining
目的:分析肾癌、前列腺癌、膀胱癌和睾丸癌全基因组关联研究( GWAS)英文文献数据的构成特征。方法对国际最新GWAS研究数据库之一———美国国立人类基因组研究所( NHGRI)数据库进行数据挖掘。结果应用文献计量学方法,客观分析了NHGRI的文献基本特征、第一第二阶段样本量、染色体区域相关(核苷酸多态性) SNP、风险等位基因频率、P值文献中最强SNP、优势比(odds ratio,OR)或β相关系数、实验平台及检测SNP数量8项数据,找出了泌尿生殖系统肿瘤GWAS的一些共性特征。结论8号染色体区域SNP多态性,可能是泌尿生殖系统肿瘤遗传易感区域,深入此易感区域研究,可能为阐述肿瘤发生、治疗及预后评估提供一定线索。
目的:分析腎癌、前列腺癌、膀胱癌和睪汍癌全基因組關聯研究( GWAS)英文文獻數據的構成特徵。方法對國際最新GWAS研究數據庫之一———美國國立人類基因組研究所( NHGRI)數據庫進行數據挖掘。結果應用文獻計量學方法,客觀分析瞭NHGRI的文獻基本特徵、第一第二階段樣本量、染色體區域相關(覈苷痠多態性) SNP、風險等位基因頻率、P值文獻中最彊SNP、優勢比(odds ratio,OR)或β相關繫數、實驗平檯及檢測SNP數量8項數據,找齣瞭泌尿生殖繫統腫瘤GWAS的一些共性特徵。結論8號染色體區域SNP多態性,可能是泌尿生殖繫統腫瘤遺傳易感區域,深入此易感區域研究,可能為闡述腫瘤髮生、治療及預後評估提供一定線索。
목적:분석신암、전렬선암、방광암화고환암전기인조관련연구( GWAS)영문문헌수거적구성특정。방법대국제최신GWAS연구수거고지일———미국국립인류기인조연구소( NHGRI)수거고진행수거알굴。결과응용문헌계량학방법,객관분석료NHGRI적문헌기본특정、제일제이계단양본량、염색체구역상관(핵감산다태성) SNP、풍험등위기인빈솔、P치문헌중최강SNP、우세비(odds ratio,OR)혹β상관계수、실험평태급검측SNP수량8항수거,조출료비뇨생식계통종류GWAS적일사공성특정。결론8호염색체구역SNP다태성,가능시비뇨생식계통종류유전역감구역,심입차역감구역연구,가능위천술종류발생、치료급예후평고제공일정선색。
Objective To analyze the data constitution features of genome -wide association study ( GWAS) in Renal cell carcinoma、Prostate cancer、Bladder cancer and Testicular cancer in English literature .Methods National human genome in-stitute GWAS database ,one of the latest international research database of GWAS ,was meticulously data mined .Results Using literature metrology method objectively analyzed 8 data of the NHGRI's basic characteristics of the literature ,the first and second stage of sample size , chromosomal regions associated SNPS , related risk allele frequency in the control group , P value with the strongest SNP in the literature , odds ratio or beta coefficient of correlation and experimental platform including testing the SNP number ,and found out the common characteristics of the urogenital system tumor GWAS .Conclusion Chromosome 8 regional SNP polymorphism may be the urogenital system tumor genetic susceptibility region ,and through into the susceptible area can pro-vide some clues in the treatment of cancer and prognosis assessment .