中国老年学杂志
中國老年學雜誌
중국노년학잡지
CHINESE JOURNAL OF GERONTOLOGY
2015年
1期
154-156
,共3页
胥冰%黄峰%霍慧春
胥冰%黃峰%霍慧春
서빙%황봉%곽혜춘
丙型肝炎病毒%包膜糖蛋白%基因型%序列分析
丙型肝炎病毒%包膜糖蛋白%基因型%序列分析
병형간염병독%포막당단백%기인형%서렬분석
目的:构建陕西地方株丙型肝炎病毒(HCV)1a、1b 和2a 型包膜糖蛋白 E1E2的原核质粒并测序比对。方法采用逆转录-巢式聚合酶链反应(RT-nest PCR)扩增获得 HCV 1a、1b 和2a 型 E1E2片段,与 pMD-18 simple vector 连接,转化感受态细菌 DH5α,小量提取质粒 DNA 并测序。测序结果与 Gene bank 中其他标准序列比对以获取同源性数据。同时重点分析 E2蛋白高变区(HVR)1和2氨基酸序列。 MEGA 4软件绘制种系进化树图。结果成功扩增约2 kb 的目的片段并构建原核质粒,测序结果正确。1b 亚型 E1E2的核苷酸和氨基酸序列的同源性最差。 HCV E2的HVR1和2的序列比对显示,同种基因亚型在 HVR 1的变异性最大,而 HVR 2的序列变异性不显著。不同基因亚型的毒株在 HVR 1和2的变异性极大,而1b 亚型在 HVR 1和2的变异性比1a 和2a 型突出。结论陕西地方株 HCV 1b 型 E1E2区比1a 和2a 型更易发生突变,1b 型 E2的 HVR 变异性更显著。
目的:構建陝西地方株丙型肝炎病毒(HCV)1a、1b 和2a 型包膜糖蛋白 E1E2的原覈質粒併測序比對。方法採用逆轉錄-巢式聚閤酶鏈反應(RT-nest PCR)擴增穫得 HCV 1a、1b 和2a 型 E1E2片段,與 pMD-18 simple vector 連接,轉化感受態細菌 DH5α,小量提取質粒 DNA 併測序。測序結果與 Gene bank 中其他標準序列比對以穫取同源性數據。同時重點分析 E2蛋白高變區(HVR)1和2氨基痠序列。 MEGA 4軟件繪製種繫進化樹圖。結果成功擴增約2 kb 的目的片段併構建原覈質粒,測序結果正確。1b 亞型 E1E2的覈苷痠和氨基痠序列的同源性最差。 HCV E2的HVR1和2的序列比對顯示,同種基因亞型在 HVR 1的變異性最大,而 HVR 2的序列變異性不顯著。不同基因亞型的毒株在 HVR 1和2的變異性極大,而1b 亞型在 HVR 1和2的變異性比1a 和2a 型突齣。結論陝西地方株 HCV 1b 型 E1E2區比1a 和2a 型更易髮生突變,1b 型 E2的 HVR 變異性更顯著。
목적:구건협서지방주병형간염병독(HCV)1a、1b 화2a 형포막당단백 E1E2적원핵질립병측서비대。방법채용역전록-소식취합매련반응(RT-nest PCR)확증획득 HCV 1a、1b 화2a 형 E1E2편단,여 pMD-18 simple vector 련접,전화감수태세균 DH5α,소량제취질립 DNA 병측서。측서결과여 Gene bank 중기타표준서렬비대이획취동원성수거。동시중점분석 E2단백고변구(HVR)1화2안기산서렬。 MEGA 4연건회제충계진화수도。결과성공확증약2 kb 적목적편단병구건원핵질립,측서결과정학。1b 아형 E1E2적핵감산화안기산서렬적동원성최차。 HCV E2적HVR1화2적서렬비대현시,동충기인아형재 HVR 1적변이성최대,이 HVR 2적서렬변이성불현저。불동기인아형적독주재 HVR 1화2적변이성겁대,이1b 아형재 HVR 1화2적변이성비1a 화2a 형돌출。결론협서지방주 HCV 1b 형 E1E2구비1a 화2a 형경역발생돌변,1b 형 E2적 HVR 변이성경현저。