畜牧与饲料科学
畜牧與飼料科學
축목여사료과학
ANIMAL HUSBANDRY AND FEED SCIENCE
2014年
12期
7-9,12
,共4页
王凤武%姜明德%付绍印%李晓奇%郭文华%闫红霞
王鳳武%薑明德%付紹印%李曉奇%郭文華%閆紅霞
왕봉무%강명덕%부소인%리효기%곽문화%염홍하
烯脂酰辅酶A水合酶短链1%重亚硫酸盐转化测序%甲基化
烯脂酰輔酶A水閤酶短鏈1%重亞硫痠鹽轉化測序%甲基化
희지선보매A수합매단련1%중아류산염전화측서%갑기화
ECHS1%sequencing of bisulfite conversion%methylation
为了检测烯脂酰辅酶A水合酶短链1(ECHS1)的甲基化状态,以同源比对克隆的方法获得荷斯坦奶牛ECHS1部分片段的序列,首先预测甲基化数目,然后采用重亚硫酸盐转化测序(BS-Seq)的方法检测了所获得片段的甲基化状态。结果表明,该试验成功获得了ECHS1459 bp的序列,其C+G含量为53.88%,含有28个CpG岛,其中1号、2号、9号、11号、13号、14号、17号、22号、24号、27号位点所有个体都发生了甲基化。
為瞭檢測烯脂酰輔酶A水閤酶短鏈1(ECHS1)的甲基化狀態,以同源比對剋隆的方法穫得荷斯坦奶牛ECHS1部分片段的序列,首先預測甲基化數目,然後採用重亞硫痠鹽轉化測序(BS-Seq)的方法檢測瞭所穫得片段的甲基化狀態。結果錶明,該試驗成功穫得瞭ECHS1459 bp的序列,其C+G含量為53.88%,含有28箇CpG島,其中1號、2號、9號、11號、13號、14號、17號、22號、24號、27號位點所有箇體都髮生瞭甲基化。
위료검측희지선보매A수합매단련1(ECHS1)적갑기화상태,이동원비대극륭적방법획득하사탄내우ECHS1부분편단적서렬,수선예측갑기화수목,연후채용중아류산염전화측서(BS-Seq)적방법검측료소획득편단적갑기화상태。결과표명,해시험성공획득료ECHS1459 bp적서렬,기C+G함량위53.88%,함유28개CpG도,기중1호、2호、9호、11호、13호、14호、17호、22호、24호、27호위점소유개체도발생료갑기화。
In order to detect the methylation status of enoyl-CoA hydratase short chain 1 (ECHS1), the sequence fragments of ECHS1 was obtained for Holstein cows by homologous cloning. The number of methylation was firstly predicted, and then methylation status of the obtained sequence fragments was detected by method of sequencing of bisulfite conversion. The results showed that fragments of ECHS1 with the size of 459 bp were obtained. C+G content was 53.88%. The fragments contained 28 CpGs islands and all individuals at sites 1, 2, 9, 11, 13, 14, 17, 22, 24 and 27 had been methylated.