中国生化药物杂志
中國生化藥物雜誌
중국생화약물잡지
CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMICAL PHARMACEUTICS
2014年
8期
102-105
,共4页
结肠癌%蛋白质相互作用网络%microRNA%转录因子%药物预测
結腸癌%蛋白質相互作用網絡%microRNA%轉錄因子%藥物預測
결장암%단백질상호작용망락%microRNA%전록인자%약물예측
colorectal cancer%protein-protein interaction network%microRNA%transcription factors%drug prediction
目的 通过生物信息学方法分析结肠癌(colorectal cancer,CRC)相关的基因,构建其蛋白质相互作用网络,并预测结肠癌的microRNA、转录因子和相关药物.方法 首先通过倍数关系值分析255个结肠癌相关的微阵列芯片样本中的表达基因,然后使用蛋白质网络数据库String构建其蛋白质相互作用网络,最后应用MSigDB 3.0分析法并结合WebGestalt在线软件,对3组数据中的表达基因进行microRNA、转录因子和药物预测.结果 本研究识别了4763个与结肠癌有关的基因,并采用表达最显著的前200个基因构建了蛋白质相互作用网络.此外,本文又采用前200个基因,通过生物信息学方法预测得到了与结肠癌有关的22条microRNA、58个转录因子和9种药物.结论 本研究识别了结肠癌的表达基因,构建了其蛋白质相互作用网络,并预测了其microRNA、转录因子和结肠癌有关药物,为结肠癌的诊断和治疗提供了潜在的生物标记.
目的 通過生物信息學方法分析結腸癌(colorectal cancer,CRC)相關的基因,構建其蛋白質相互作用網絡,併預測結腸癌的microRNA、轉錄因子和相關藥物.方法 首先通過倍數關繫值分析255箇結腸癌相關的微陣列芯片樣本中的錶達基因,然後使用蛋白質網絡數據庫String構建其蛋白質相互作用網絡,最後應用MSigDB 3.0分析法併結閤WebGestalt在線軟件,對3組數據中的錶達基因進行microRNA、轉錄因子和藥物預測.結果 本研究識彆瞭4763箇與結腸癌有關的基因,併採用錶達最顯著的前200箇基因構建瞭蛋白質相互作用網絡.此外,本文又採用前200箇基因,通過生物信息學方法預測得到瞭與結腸癌有關的22條microRNA、58箇轉錄因子和9種藥物.結論 本研究識彆瞭結腸癌的錶達基因,構建瞭其蛋白質相互作用網絡,併預測瞭其microRNA、轉錄因子和結腸癌有關藥物,為結腸癌的診斷和治療提供瞭潛在的生物標記.
목적 통과생물신식학방법분석결장암(colorectal cancer,CRC)상관적기인,구건기단백질상호작용망락,병예측결장암적microRNA、전록인자화상관약물.방법 수선통과배수관계치분석255개결장암상관적미진렬심편양본중적표체기인,연후사용단백질망락수거고String구건기단백질상호작용망락,최후응용MSigDB 3.0분석법병결합WebGestalt재선연건,대3조수거중적표체기인진행microRNA、전록인자화약물예측.결과 본연구식별료4763개여결장암유관적기인,병채용표체최현저적전200개기인구건료단백질상호작용망락.차외,본문우채용전200개기인,통과생물신식학방법예측득도료여결장암유관적22조microRNA、58개전록인자화9충약물.결론 본연구식별료결장암적표체기인,구건료기단백질상호작용망락,병예측료기microRNA、전록인자화결장암유관약물,위결장암적진단화치료제공료잠재적생물표기.
