中华实验外科杂志
中華實驗外科雜誌
중화실험외과잡지
CHINESE JOURNAL OF EXPERIMENTAL SURGERY
2014年
12期
2732-2734
,共3页
王芹芹%胡慧%崔军威%韦伟
王芹芹%鬍慧%崔軍威%韋偉
왕근근%호혜%최군위%위위
单链DNA%适配子%三阴乳腺癌
單鏈DNA%適配子%三陰乳腺癌
단련DNA%괄배자%삼음유선암
Single-stranded DNA%Aptamer%Triple negative breast cancer
目的 优化三阴乳腺癌(TNBC)适配子筛选中单链DNA(ssDNA)文库扩增条件,探讨次级ssDNA最佳制备方法.方法 构建ssDNA文库,设置不同的模板量(1012、1011、1010、109、108、107、106、105条带)、循环数(9、12、15、18、21、24、27、30)、DNA聚合酶量(0.025、0.050、0.100、0.200、0.400 U/μl)进行聚合酶链反应(PCR)扩增;对比3种制备次级ssDNA的方法,取其中最佳方法进行筛选.结果 20μl体系最优扩增条件为:ssDNA模板量108个条带、扩增循环数为12、DNA聚合酶量为0.100 U/μl;不对称PCR法所得ssDNA量最多.结论 确立了ssDNA文库最优扩增条件及次级ssDNA最佳制备方法,为进一步筛选TNBC特异性适配子提供实验基础.
目的 優化三陰乳腺癌(TNBC)適配子篩選中單鏈DNA(ssDNA)文庫擴增條件,探討次級ssDNA最佳製備方法.方法 構建ssDNA文庫,設置不同的模闆量(1012、1011、1010、109、108、107、106、105條帶)、循環數(9、12、15、18、21、24、27、30)、DNA聚閤酶量(0.025、0.050、0.100、0.200、0.400 U/μl)進行聚閤酶鏈反應(PCR)擴增;對比3種製備次級ssDNA的方法,取其中最佳方法進行篩選.結果 20μl體繫最優擴增條件為:ssDNA模闆量108箇條帶、擴增循環數為12、DNA聚閤酶量為0.100 U/μl;不對稱PCR法所得ssDNA量最多.結論 確立瞭ssDNA文庫最優擴增條件及次級ssDNA最佳製備方法,為進一步篩選TNBC特異性適配子提供實驗基礎.
목적 우화삼음유선암(TNBC)괄배자사선중단련DNA(ssDNA)문고확증조건,탐토차급ssDNA최가제비방법.방법 구건ssDNA문고,설치불동적모판량(1012、1011、1010、109、108、107、106、105조대)、순배수(9、12、15、18、21、24、27、30)、DNA취합매량(0.025、0.050、0.100、0.200、0.400 U/μl)진행취합매련반응(PCR)확증;대비3충제비차급ssDNA적방법,취기중최가방법진행사선.결과 20μl체계최우확증조건위:ssDNA모판량108개조대、확증순배수위12、DNA취합매량위0.100 U/μl;불대칭PCR법소득ssDNA량최다.결론 학립료ssDNA문고최우확증조건급차급ssDNA최가제비방법,위진일보사선TNBC특이성괄배자제공실험기출.
Objective To optimize the polymerase chain reaction (PCR) amplification conditions of single-stranded DNA (ssDNA) pool and evaluate different methods for generation of ssDNA in selecting targeted aptamers of triple negative breast cancer (TNBC) by systematic evaluation of ligands by exponential enrichment (SELEX).Methods ssDNA library was synthesized.The initial template concentration (1012,1011,1010,109,108,107,106 and 105 sequences),amplification cycles (9,12,15,18,21,24,27 and 30) and DNA polymerase concentrations (0.025,0.050,0.100,0.200,and 0.400 U/μl) were set up for the amplification of random ssDNA.Efficiency of ssDNA generation was evaluated by comparing three most used methods.Results The optimal ssDNA template concentration was 108 sequences,cycle number was 12 and DNA polymerase concentration was 0.100 U/μl with a total system volume of 20 μl.Asymmetric PCR produced the highest amount of ssDNA.Conclusion The PCR amplification conditions of ssDNA library and the best method to generate ssDNA were established,which laid experimental foundations for the further selection of TNBC targeted aptamers.