国际遗传学杂志
國際遺傳學雜誌
국제유전학잡지
INTERNATIONAL JOURNAL OF GENETICS
2015年
1期
24-28
,共5页
陈传庚%段斌%廖高明%闻懿%常志强
陳傳庚%段斌%廖高明%聞懿%常誌彊
진전경%단빈%료고명%문의%상지강
差异共表达%差异表达%易感基因
差異共錶達%差異錶達%易感基因
차이공표체%차이표체%역감기인
Differential co-expression%Differential expression%Sensitive gene
目的 解析肺癌敏感基因和基因间异常关系.方法 通过比较肺癌样本和对照样本,寻找肺癌细胞中出现的差异表达的基因和差异共表达基因对,将差异表达基因映射到差异共表达网络中,运用网络中节点重要性的度、脆弱性、介数和接近中心性进行排序,筛选肺癌敏感基因.结果 共挖掘得到15个具有重要作用的肺癌相关基因,其中有1 3个基因在肺癌表达谱中存在差异表达.另外,基因CCL19和TNFSF 13B虽然不存在表达差异性,但是它们的微小改变能够直接影响着其他基因的显著改变.结论 本文在差异表达和共表达研究基础上挖掘得到的新基因对于肺癌机制研究是重要的补充,而且发现了某些基因的微小改变可引起其他基因表达异常,这为进一步了解肺癌发生发展机制奠定了基础.
目的 解析肺癌敏感基因和基因間異常關繫.方法 通過比較肺癌樣本和對照樣本,尋找肺癌細胞中齣現的差異錶達的基因和差異共錶達基因對,將差異錶達基因映射到差異共錶達網絡中,運用網絡中節點重要性的度、脆弱性、介數和接近中心性進行排序,篩選肺癌敏感基因.結果 共挖掘得到15箇具有重要作用的肺癌相關基因,其中有1 3箇基因在肺癌錶達譜中存在差異錶達.另外,基因CCL19和TNFSF 13B雖然不存在錶達差異性,但是它們的微小改變能夠直接影響著其他基因的顯著改變.結論 本文在差異錶達和共錶達研究基礎上挖掘得到的新基因對于肺癌機製研究是重要的補充,而且髮現瞭某些基因的微小改變可引起其他基因錶達異常,這為進一步瞭解肺癌髮生髮展機製奠定瞭基礎.
목적 해석폐암민감기인화기인간이상관계.방법 통과비교폐암양본화대조양본,심조폐암세포중출현적차이표체적기인화차이공표체기인대,장차이표체기인영사도차이공표체망락중,운용망락중절점중요성적도、취약성、개수화접근중심성진행배서,사선폐암민감기인.결과 공알굴득도15개구유중요작용적폐암상관기인,기중유1 3개기인재폐암표체보중존재차이표체.령외,기인CCL19화TNFSF 13B수연불존재표체차이성,단시타문적미소개변능구직접영향착기타기인적현저개변.결론 본문재차이표체화공표체연구기출상알굴득도적신기인대우폐암궤제연구시중요적보충,이차발현료모사기인적미소개변가인기기타기인표체이상,저위진일보료해폐암발생발전궤제전정료기출.
Objective Discover the sensitive genes of lung cancer and their relationships.Methods Searching the genes with differential expression and gene pairs with differential co-expression in lung cancer,through comparing the samples of lung cancer and control,then we mapped the genes into differential co-expressed networks,sorted the important node with degree,betweenness,vulnerability and closeness centrality respectively,and sorted the genes with the sum of these four characters to filter the sensitive genes.Results 15 important lung associated genes were found in lung cancer,including 13 differential expressed genes.We also found that the expression of CCL19 and TNFSF13B could significantly decrease of expression of other genes even though they were not included in the list of differential expression genes.Conclusion These genes mined by this research provided an important supplementary to the etiology of lung cancer.
