西北植物学报
西北植物學報
서북식물학보
ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA
2015年
1期
37-43
,共7页
无苞芥%OpNAC026%克隆%抗逆%基因表达
無苞芥%OpNAC026%剋隆%抗逆%基因錶達
무포개%OpNAC026%극륭%항역%기인표체
Olimarabidopsis pumila%OpNAC026%cloning%stress tolerance%gene expression
在新疆耐逆植物无苞芥幼苗cDNA文库的随机克隆测序结果中,发现1条与拟南芥NAC转录因子基因AtNAC026高度相似的5'端EST序列(GenBank登录号为JZ151854),对该克隆进行3 '端测序,拼接得到一条全长1 327 bp的cDNA序列,该序列包含一个906 bp的最大开放阅读框(ORF),推测编码301个氨基酸.根据该ORF序列设计引物,利用RT-PCR技术对其进行克隆,将该基因命名为OpNAC026(GenBank登录号为KM457621).理化性质分析表明,OpNAC026蛋白是一个无跨膜区域的亲水蛋白,在N端具有一段保守结构域;蛋白质二级结构预测显示,OpNAC026蛋白包含54个α-螺旋和12个β-转角.系统进化树分析表明,OpNAC026基因与拟南芥AtNAC026和AtNAM进化关系最近.实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析显示,OpNAC026基因在无苞芥的各组织中都有表达,在叶中表达量最高;高盐胁迫处理24 h、干旱12 h、ABA 6 h、4℃低温8h处理均可明显诱导OpNAC026基因的表达.研究表明,OpNAC026基因可能参与无苞芥抗逆机制的调控.
在新疆耐逆植物無苞芥幼苗cDNA文庫的隨機剋隆測序結果中,髮現1條與擬南芥NAC轉錄因子基因AtNAC026高度相似的5'耑EST序列(GenBank登錄號為JZ151854),對該剋隆進行3 '耑測序,拼接得到一條全長1 327 bp的cDNA序列,該序列包含一箇906 bp的最大開放閱讀框(ORF),推測編碼301箇氨基痠.根據該ORF序列設計引物,利用RT-PCR技術對其進行剋隆,將該基因命名為OpNAC026(GenBank登錄號為KM457621).理化性質分析錶明,OpNAC026蛋白是一箇無跨膜區域的親水蛋白,在N耑具有一段保守結構域;蛋白質二級結構預測顯示,OpNAC026蛋白包含54箇α-螺鏇和12箇β-轉角.繫統進化樹分析錶明,OpNAC026基因與擬南芥AtNAC026和AtNAM進化關繫最近.實時熒光定量PCR (qRT-PCR)分析顯示,OpNAC026基因在無苞芥的各組織中都有錶達,在葉中錶達量最高;高鹽脅迫處理24 h、榦旱12 h、ABA 6 h、4℃低溫8h處理均可明顯誘導OpNAC026基因的錶達.研究錶明,OpNAC026基因可能參與無苞芥抗逆機製的調控.
재신강내역식물무포개유묘cDNA문고적수궤극륭측서결과중,발현1조여의남개NAC전록인자기인AtNAC026고도상사적5'단EST서렬(GenBank등록호위JZ151854),대해극륭진행3 '단측서,병접득도일조전장1 327 bp적cDNA서렬,해서렬포함일개906 bp적최대개방열독광(ORF),추측편마301개안기산.근거해ORF서렬설계인물,이용RT-PCR기술대기진행극륭,장해기인명명위OpNAC026(GenBank등록호위KM457621).이화성질분석표명,OpNAC026단백시일개무과막구역적친수단백,재N단구유일단보수결구역;단백질이급결구예측현시,OpNAC026단백포함54개α-라선화12개β-전각.계통진화수분석표명,OpNAC026기인여의남개AtNAC026화AtNAM진화관계최근.실시형광정량PCR (qRT-PCR)분석현시,OpNAC026기인재무포개적각조직중도유표체,재협중표체량최고;고염협박처리24 h、간한12 h、ABA 6 h、4℃저온8h처리균가명현유도OpNAC026기인적표체.연구표명,OpNAC026기인가능삼여무포개항역궤제적조공.