江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
2期
33-37
,共5页
梁志强%孔德真%李辉玲%裴娟%祝建波%王爱英
樑誌彊%孔德真%李輝玲%裴娟%祝建波%王愛英
량지강%공덕진%리휘령%배연%축건파%왕애영
小拟南芥%HDG12基因%克隆%生物信息学
小擬南芥%HDG12基因%剋隆%生物信息學
소의남개%HDG12기인%극륭%생물신식학
以小拟南芥基因组DNA为模板,运用同源克隆法获得小拟南芥HDG12基因,命名为ApHDG12。运用生物信息学方法,对ApHDG12基因的理化性质、保守序列、二级结构、亚细胞定位等进行了分析,并进行同源建模。经测序和生物信息学软件预测分析,结果显示,ApHDG12基因由10个外显子和9个内含子组成,mRNA长度为2064 bp,编码687个氨基酸,亚细胞定位于细胞核。系统进化树显示ApHDG12与Capsella rubella遗传距离最近,CDD保守序列分析结果显示ApHDG12有18~79位的同源异型域和206~436位的START结构域,属于HD-zipⅣ类基因家族,同时构建了植物表达载体pBI121:HDG12,转化到农杆菌GV3101中,为进一步研究基因功能奠定基础。
以小擬南芥基因組DNA為模闆,運用同源剋隆法穫得小擬南芥HDG12基因,命名為ApHDG12。運用生物信息學方法,對ApHDG12基因的理化性質、保守序列、二級結構、亞細胞定位等進行瞭分析,併進行同源建模。經測序和生物信息學軟件預測分析,結果顯示,ApHDG12基因由10箇外顯子和9箇內含子組成,mRNA長度為2064 bp,編碼687箇氨基痠,亞細胞定位于細胞覈。繫統進化樹顯示ApHDG12與Capsella rubella遺傳距離最近,CDD保守序列分析結果顯示ApHDG12有18~79位的同源異型域和206~436位的START結構域,屬于HD-zipⅣ類基因傢族,同時構建瞭植物錶達載體pBI121:HDG12,轉化到農桿菌GV3101中,為進一步研究基因功能奠定基礎。
이소의남개기인조DNA위모판,운용동원극륭법획득소의남개HDG12기인,명명위ApHDG12。운용생물신식학방법,대ApHDG12기인적이화성질、보수서렬、이급결구、아세포정위등진행료분석,병진행동원건모。경측서화생물신식학연건예측분석,결과현시,ApHDG12기인유10개외현자화9개내함자조성,mRNA장도위2064 bp,편마687개안기산,아세포정위우세포핵。계통진화수현시ApHDG12여Capsella rubella유전거리최근,CDD보수서렬분석결과현시ApHDG12유18~79위적동원이형역화206~436위적START결구역,속우HD-zipⅣ류기인가족,동시구건료식물표체재체pBI121:HDG12,전화도농간균GV3101중,위진일보연구기인공능전정기출。