江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
2期
20-23
,共4页
蛋白质%βαβ模体%离散增量%优化的参量%优化位点氨基酸%识别精度
蛋白質%βαβ模體%離散增量%優化的參量%優化位點氨基痠%識彆精度
단백질%βαβ모체%리산증량%우화적삼량%우화위점안기산%식별정도
选取了来自1423个相似性小于33%的蛋白质序列的1459个βαβ模体和2419个非βαβ模体,通过分析模体中各二级结构单元的分布情况,确定固定序列模式长。基于优化的氨基酸信息,利用离散增量算法识别βαβ模体。运用10-fold交叉检验和独立检验方法对算法进行检验,识别总精度分别达到79.4%和78.6%。
選取瞭來自1423箇相似性小于33%的蛋白質序列的1459箇βαβ模體和2419箇非βαβ模體,通過分析模體中各二級結構單元的分佈情況,確定固定序列模式長。基于優化的氨基痠信息,利用離散增量算法識彆βαβ模體。運用10-fold交扠檢驗和獨立檢驗方法對算法進行檢驗,識彆總精度分彆達到79.4%和78.6%。
선취료래자1423개상사성소우33%적단백질서렬적1459개βαβ모체화2419개비βαβ모체,통과분석모체중각이급결구단원적분포정황,학정고정서렬모식장。기우우화적안기산신식,이용리산증량산법식별βαβ모체。운용10-fold교차검험화독립검험방법대산법진행검험,식별총정도분별체도79.4%화78.6%。