山东农业科学
山東農業科學
산동농업과학
SHANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
2期
1-6
,共6页
葛姗姗%唐桂英%毕玉平%柳展基
葛姍姍%唐桂英%畢玉平%柳展基
갈산산%당계영%필옥평%류전기
玉米%NAC基因家族%生物信息学
玉米%NAC基因傢族%生物信息學
옥미%NAC기인가족%생물신식학
Maize%NAC gene family%Bioinformatics
本试验利用生物信息学方法预测了玉米NAC基因家族成员、基因结构、染色体定位和系统进化关系。结果表明,玉米NAC基因家族包含128个成员,依据其在染色体上的位置系统命名为ZmNAC001~ZmNAC128;ZmNAC分布在10条染色体上,且分布不均;ZmNAC基因与拟南芥NAC基因具有一定相似性,可分为13个亚家族;基因结构分析发现绝大多数ZmNAC基因含有1~3个内含子;miRNA靶基因预测发现7个ZmNAC基因为miRNA164的靶基因。
本試驗利用生物信息學方法預測瞭玉米NAC基因傢族成員、基因結構、染色體定位和繫統進化關繫。結果錶明,玉米NAC基因傢族包含128箇成員,依據其在染色體上的位置繫統命名為ZmNAC001~ZmNAC128;ZmNAC分佈在10條染色體上,且分佈不均;ZmNAC基因與擬南芥NAC基因具有一定相似性,可分為13箇亞傢族;基因結構分析髮現絕大多數ZmNAC基因含有1~3箇內含子;miRNA靶基因預測髮現7箇ZmNAC基因為miRNA164的靶基因。
본시험이용생물신식학방법예측료옥미NAC기인가족성원、기인결구、염색체정위화계통진화관계。결과표명,옥미NAC기인가족포함128개성원,의거기재염색체상적위치계통명명위ZmNAC001~ZmNAC128;ZmNAC분포재10조염색체상,차분포불균;ZmNAC기인여의남개NAC기인구유일정상사성,가분위13개아가족;기인결구분석발현절대다수ZmNAC기인함유1~3개내함자;miRNA파기인예측발현7개ZmNAC기인위miRNA164적파기인。
The NAC gene family in maize ( Zea mays L.) was comprehensively identified by bioinformat-ics in this research , including gene members , gene structure , chromosome location and phylogenetic relation-ship.As a result, 128 NAC genes were predicted and named as ZmNAC001~ZmNAC128 according to their chromosome location .The 128 ZmNAC unevenly distributed on 10 chromosomes of maize .Phylogenetic analy-sis suggested that ZmNAC genes had certain similarities with NAC genes from Arabidopsis and could be divided into 13 subfamilies.Gene structure analysis showed that most ZmNAC genes contained 1~3 introns.Seven ZmNAC genes were predicted as the target genes of miRNA 164 .