山西农业科学
山西農業科學
산서농업과학
JOURNAL OF SHANXI AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
1期
71-74,84
,共5页
桑青枯雷尔氏菌%Ⅱ型分泌系统%gsp基因%序列分析
桑青枯雷爾氏菌%Ⅱ型分泌繫統%gsp基因%序列分析
상청고뢰이씨균%Ⅱ형분비계통%gsp기인%서렬분석
mulberry Ralstonia solanacearum%type Ⅱ secretion system%gsp genes%sequence analysis
Ⅱ型分泌系统广泛存在于革兰氏阴性细菌中,转膜蛋白基因簇是其分泌途径的中心.利用PCR扩增和测序,获得了桑青枯雷尔氏菌MR111的gspC基因707 bp和gspM基因575 bp的序列,SMART软件预测gspC基因编码的7～29位氨基酸为跨膜结构域,羧基末端无PDZ结构,gspM的胞质结构域有2个α螺旋和4个β折叠.使用gspC和gspM的保守序列组成的联合矩阵构建系统发育树,结果表明,桑青枯雷尔氏菌MR111与罗尔斯顿氏菌和雷尔氏菌属优先聚合在同一分支,伯克氏菌和伯克霍尔氏菌位于较远分支.
Ⅱ型分泌繫統廣汎存在于革蘭氏陰性細菌中,轉膜蛋白基因簇是其分泌途徑的中心.利用PCR擴增和測序,穫得瞭桑青枯雷爾氏菌MR111的gspC基因707 bp和gspM基因575 bp的序列,SMART軟件預測gspC基因編碼的7～29位氨基痠為跨膜結構域,羧基末耑無PDZ結構,gspM的胞質結構域有2箇α螺鏇和4箇β摺疊.使用gspC和gspM的保守序列組成的聯閤矩陣構建繫統髮育樹,結果錶明,桑青枯雷爾氏菌MR111與囉爾斯頓氏菌和雷爾氏菌屬優先聚閤在同一分支,伯剋氏菌和伯剋霍爾氏菌位于較遠分支.
Ⅱ형분비계통엄범존재우혁란씨음성세균중,전막단백기인족시기분비도경적중심.이용PCR확증화측서,획득료상청고뢰이씨균MR111적gspC기인707 bp화gspM기인575 bp적서렬,SMART연건예측gspC기인편마적7～29위안기산위과막결구역,최기말단무PDZ결구,gspM적포질결구역유2개α라선화4개β절첩.사용gspC화gspM적보수서렬조성적연합구진구건계통발육수,결과표명,상청고뢰이씨균MR111여라이사돈씨균화뢰이씨균속우선취합재동일분지,백극씨균화백극곽이씨균위우교원분지.
