天津医科大学学报
天津醫科大學學報
천진의과대학학보
JOURNAL OF TIANJIN MEDICAL UNIVERSITY
2015年
1期
25-28
,共4页
魏会宇%金媛媛%王梅燕%朱立勤
魏會宇%金媛媛%王梅燕%硃立勤
위회우%금원원%왕매연%주립근
计算机辅助药物设计%药效团模型%SHP-2抑制剂
計算機輔助藥物設計%藥效糰模型%SHP-2抑製劑
계산궤보조약물설계%약효단모형%SHP-2억제제
computer aided drug design%pharmacophore model%SHP-2 inhibitors
目的:构建并应用蛋白酪氨酸磷酸酶SHP-2抑制剂药效团模型.方法:应用Discovery Studio 3.5软件包中的基于分子共同特征HipHop和基于配体-受体晶体复合物CPB两种算法构建出SHP-2抑制剂药效团模型,应用Receiver-operating curve(ROC)分析方法对产生的药效团模型进行验证并对ZINC数据库进行筛选,最后应用Schrodinger Suite 2009中的Qikprop模块预测这些化合物的吸收、分布、代谢、排泄的性质,并与已报道的部分化合物作比较.结果:应用HipHop和CPB两种算法分别构建了识别活性与非活性分子能力最强的药效团模型,并且通过这两个模型筛选出了35个具有潜在SHP-2抑制活性的化合物,通过ADME预测得出设计出的化合物具有较好的ADME性质.结论:该两种药效团模型可以用于后续SHP-2小分子药物的筛选和优化,且采用两种药效团联合筛选的方法为计算机辅助药物设计提供了一个新的思路.
目的:構建併應用蛋白酪氨痠燐痠酶SHP-2抑製劑藥效糰模型.方法:應用Discovery Studio 3.5軟件包中的基于分子共同特徵HipHop和基于配體-受體晶體複閤物CPB兩種算法構建齣SHP-2抑製劑藥效糰模型,應用Receiver-operating curve(ROC)分析方法對產生的藥效糰模型進行驗證併對ZINC數據庫進行篩選,最後應用Schrodinger Suite 2009中的Qikprop模塊預測這些化閤物的吸收、分佈、代謝、排洩的性質,併與已報道的部分化閤物作比較.結果:應用HipHop和CPB兩種算法分彆構建瞭識彆活性與非活性分子能力最彊的藥效糰模型,併且通過這兩箇模型篩選齣瞭35箇具有潛在SHP-2抑製活性的化閤物,通過ADME預測得齣設計齣的化閤物具有較好的ADME性質.結論:該兩種藥效糰模型可以用于後續SHP-2小分子藥物的篩選和優化,且採用兩種藥效糰聯閤篩選的方法為計算機輔助藥物設計提供瞭一箇新的思路.
목적:구건병응용단백락안산린산매SHP-2억제제약효단모형.방법:응용Discovery Studio 3.5연건포중적기우분자공동특정HipHop화기우배체-수체정체복합물CPB량충산법구건출SHP-2억제제약효단모형,응용Receiver-operating curve(ROC)분석방법대산생적약효단모형진행험증병대ZINC수거고진행사선,최후응용Schrodinger Suite 2009중적Qikprop모괴예측저사화합물적흡수、분포、대사、배설적성질,병여이보도적부분화합물작비교.결과:응용HipHop화CPB량충산법분별구건료식별활성여비활성분자능력최강적약효단모형,병차통과저량개모형사선출료35개구유잠재SHP-2억제활성적화합물,통과ADME예측득출설계출적화합물구유교호적ADME성질.결론:해량충약효단모형가이용우후속SHP-2소분자약물적사선화우화,차채용량충약효단연합사선적방법위계산궤보조약물설계제공료일개신적사로.
