中国生物医学工程学报
中國生物醫學工程學報
중국생물의학공정학보
CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING
2015年
1期
8-16
,共9页
刘汉明%饶妮妮%李益%罗恒荣%杨阳%杨锋
劉漢明%饒妮妮%李益%囉恆榮%楊暘%楊鋒
류한명%요니니%리익%라항영%양양%양봉
最大信息系数%心房颤动%差异表达基因
最大信息繫數%心房顫動%差異錶達基因
최대신식계수%심방전동%차이표체기인
maximal information coefficient%atrial fibrillation%differentially expressed gene
心房颤动是一种常见的、与年龄相关的心律失常,由其所导致的脑卒中具有高致残率和致死率.通过对高通量基因表达谱的分析,可以帮助理解心房颤动的生物学过程和功能紊乱机制,并发现相关致病基因.新型的非参数统计方法——最大信息系数,在探索双变量之间的关联方面具有独特的优点.利用该方法,发现差异与非差异基因表达值与样本表型之间的关联程度不同,构建差异表达基因识别方法.对永久性房颤基因表达谱GSE2240的分析,识别出41个差异表达基因,其中有14基因是已有工作未发现的新差异表达基因.信号通路和富集分析表明,这些差异表达基因与房颤高度相关.同时,对乳腺癌基因表达数据GSE24037的分析,进一步说明该方法在差异表达基因识别方面的有效性.最大信息系数的非参数特性与抗噪能力,使它非常适合于差异表达基因的识别.
心房顫動是一種常見的、與年齡相關的心律失常,由其所導緻的腦卒中具有高緻殘率和緻死率.通過對高通量基因錶達譜的分析,可以幫助理解心房顫動的生物學過程和功能紊亂機製,併髮現相關緻病基因.新型的非參數統計方法——最大信息繫數,在探索雙變量之間的關聯方麵具有獨特的優點.利用該方法,髮現差異與非差異基因錶達值與樣本錶型之間的關聯程度不同,構建差異錶達基因識彆方法.對永久性房顫基因錶達譜GSE2240的分析,識彆齣41箇差異錶達基因,其中有14基因是已有工作未髮現的新差異錶達基因.信號通路和富集分析錶明,這些差異錶達基因與房顫高度相關.同時,對乳腺癌基因錶達數據GSE24037的分析,進一步說明該方法在差異錶達基因識彆方麵的有效性.最大信息繫數的非參數特性與抗譟能力,使它非常適閤于差異錶達基因的識彆.
심방전동시일충상견적、여년령상관적심률실상,유기소도치적뇌졸중구유고치잔솔화치사솔.통과대고통량기인표체보적분석,가이방조리해심방전동적생물학과정화공능문란궤제,병발현상관치병기인.신형적비삼수통계방법——최대신식계수,재탐색쌍변량지간적관련방면구유독특적우점.이용해방법,발현차이여비차이기인표체치여양본표형지간적관련정도불동,구건차이표체기인식별방법.대영구성방전기인표체보GSE2240적분석,식별출41개차이표체기인,기중유14기인시이유공작미발현적신차이표체기인.신호통로화부집분석표명,저사차이표체기인여방전고도상관.동시,대유선암기인표체수거GSE24037적분석,진일보설명해방법재차이표체기인식별방면적유효성.최대신식계수적비삼수특성여항조능력,사타비상괄합우차이표체기인적식별.
