河南农业科学
河南農業科學
하남농업과학
JOURNAL OF HENAN AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
12期
34-39
,共6页
王金朋%聂林曼%王振怡%马雪莲%张琼
王金朋%聶林曼%王振怡%馬雪蓮%張瓊
왕금붕%섭림만%왕진이%마설련%장경
谷子%玉米%重复基因%基因置换%系统发育分析
穀子%玉米%重複基因%基因置換%繫統髮育分析
곡자%옥미%중복기인%기인치환%계통발육분석
Setaria italica%Zea mays%duplicated genes%gene conversion%phylogenetic analysis
以谷子和玉米为研究对象,利用系统发育分析和比较基因组学推断了重复基因间可能的基因置换,旨在对其基因组中由全基因组加倍产生的重复基因的相互作用机制进行研究.结果表明,谷子中有192对(18.9％)、玉米中有121对(11.9％)的重复基因在其进化过程中发生了基因置换,且重复基因对之间的置换常常是以部分基因置换为主,谷子发生置换的基因对中有88.4％、玉米中有76.5％是部分基因置换;基于动态规划和系统发育相结合的方法,确定了谷子、玉米多个重复基因对间发生过不止1个片段的基因置换;对基因置换与重复基因在染色体上物理位置的相关性分析发现,基因置换与基因在染色体上的位置显著相关,对不同染色体区域重复基因发生置换的频率进行统计分析表明,靠近染色体末端的重复基因对更易发生置换.
以穀子和玉米為研究對象,利用繫統髮育分析和比較基因組學推斷瞭重複基因間可能的基因置換,旨在對其基因組中由全基因組加倍產生的重複基因的相互作用機製進行研究.結果錶明,穀子中有192對(18.9％)、玉米中有121對(11.9％)的重複基因在其進化過程中髮生瞭基因置換,且重複基因對之間的置換常常是以部分基因置換為主,穀子髮生置換的基因對中有88.4％、玉米中有76.5％是部分基因置換;基于動態規劃和繫統髮育相結閤的方法,確定瞭穀子、玉米多箇重複基因對間髮生過不止1箇片段的基因置換;對基因置換與重複基因在染色體上物理位置的相關性分析髮現,基因置換與基因在染色體上的位置顯著相關,對不同染色體區域重複基因髮生置換的頻率進行統計分析錶明,靠近染色體末耑的重複基因對更易髮生置換.
이곡자화옥미위연구대상,이용계통발육분석화비교기인조학추단료중복기인간가능적기인치환,지재대기기인조중유전기인조가배산생적중복기인적상호작용궤제진행연구.결과표명,곡자중유192대(18.9％)、옥미중유121대(11.9％)적중복기인재기진화과정중발생료기인치환,차중복기인대지간적치환상상시이부분기인치환위주,곡자발생치환적기인대중유88.4％、옥미중유76.5％시부분기인치환;기우동태규화화계통발육상결합적방법,학정료곡자、옥미다개중복기인대간발생과불지1개편단적기인치환;대기인치환여중복기인재염색체상물리위치적상관성분석발현,기인치환여기인재염색체상적위치현저상관,대불동염색체구역중복기인발생치환적빈솔진행통계분석표명,고근염색체말단적중복기인대경역발생치환.
