茶叶通讯
茶葉通訊
다협통신
TEA COMMUNICATION
2014年
4期
13-17
,共5页
赵洋%刘振%杨培迪%成杨%杨阳
趙洋%劉振%楊培迪%成楊%楊暘
조양%류진%양배적%성양%양양
茶树(Camellia sinensis)%肌动蛋白%密码子偏性
茶樹(Camellia sinensis)%肌動蛋白%密碼子偏性
다수(Camellia sinensis)%기동단백%밀마자편성
运用CUSP、CodonW、CHIPS程序分析茶树肌动蛋白基因CsActin1的密码偏性,并将其与茶树基因组密码子偏性比较,以及与其它9种植物肌动蛋白基因进行基于密码子偏性和CDS序列的聚类分析.结果显示,CsA ctin1相对密码子使用度(RSCU)与茶树基因组比较,只有6种氨基酸的密码子偏性一致,且没有如茶树基因组一样偏好使用A/T结尾的密码子,肌动蛋白基因基于RSCU的聚类结果与基于CDS序列的聚类结果虽存在差异,但都能在一定程度上反映物种间的亲缘关系.
運用CUSP、CodonW、CHIPS程序分析茶樹肌動蛋白基因CsActin1的密碼偏性,併將其與茶樹基因組密碼子偏性比較,以及與其它9種植物肌動蛋白基因進行基于密碼子偏性和CDS序列的聚類分析.結果顯示,CsA ctin1相對密碼子使用度(RSCU)與茶樹基因組比較,隻有6種氨基痠的密碼子偏性一緻,且沒有如茶樹基因組一樣偏好使用A/T結尾的密碼子,肌動蛋白基因基于RSCU的聚類結果與基于CDS序列的聚類結果雖存在差異,但都能在一定程度上反映物種間的親緣關繫.
운용CUSP、CodonW、CHIPS정서분석다수기동단백기인CsActin1적밀마편성,병장기여다수기인조밀마자편성비교,이급여기타9충식물기동단백기인진행기우밀마자편성화CDS서렬적취류분석.결과현시,CsA ctin1상대밀마자사용도(RSCU)여다수기인조비교,지유6충안기산적밀마자편성일치,차몰유여다수기인조일양편호사용A/T결미적밀마자,기동단백기인기우RSCU적취류결과여기우CDS서렬적취류결과수존재차이,단도능재일정정도상반영물충간적친연관계.
