军事医学
軍事醫學
군사의학
BULLETIN OF THE ACADEMY OF MILITARY MEDICAL SCIENCES
2015年
1期
71-74
,共4页
李江域%王小磊%毛逸清%赵东升
李江域%王小磊%毛逸清%趙東升
리강역%왕소뢰%모일청%조동승
高通量测序%微生物检测%生物信息学%算法
高通量測序%微生物檢測%生物信息學%算法
고통량측서%미생물검측%생물신식학%산법
high throughput sequencing%microorganism detection%bioinformatics%algorithms
新一代高通量测序技术的发展,推动了多个相关研究领域的发展。国际上许多研究机构正在研究利用高通量测序数据进行微生物检测的算法,目前已有一些基于高通量测序数据的微生物检测算法流程设计成功并公开发布。该文通过调研利用高通量测序数据进行微生物检测的相关文献,研究已发布的基于高通量测序数据的微生物检测算法的功能和实现流程,分析几个有代表性算法的优点和不足。最后,对这些检测算法的设计思路进行总结和分类,提出基于高通量测序数据的微生物检测算法的改进设想。
新一代高通量測序技術的髮展,推動瞭多箇相關研究領域的髮展。國際上許多研究機構正在研究利用高通量測序數據進行微生物檢測的算法,目前已有一些基于高通量測序數據的微生物檢測算法流程設計成功併公開髮佈。該文通過調研利用高通量測序數據進行微生物檢測的相關文獻,研究已髮佈的基于高通量測序數據的微生物檢測算法的功能和實現流程,分析幾箇有代錶性算法的優點和不足。最後,對這些檢測算法的設計思路進行總結和分類,提齣基于高通量測序數據的微生物檢測算法的改進設想。
신일대고통량측서기술적발전,추동료다개상관연구영역적발전。국제상허다연구궤구정재연구이용고통량측서수거진행미생물검측적산법,목전이유일사기우고통량측서수거적미생물검측산법류정설계성공병공개발포。해문통과조연이용고통량측서수거진행미생물검측적상관문헌,연구이발포적기우고통량측서수거적미생물검측산법적공능화실현류정,분석궤개유대표성산법적우점화불족。최후,대저사검측산법적설계사로진행총결화분류,제출기우고통량측서수거적미생물검측산법적개진설상。
The development of high throughput sequencing technology has promoted the development of many related spheres of research .Many research institutions are studying algorithms of microorganism detection using high throughput se -quencing data .Some algorithms have already been designed and published .In this paper , we investigated the literature re-garding the use of high throughput sequencing data for microorganism detection , studied the function and workflow of four released algorithms of microorganism detection based on high throughput sequencing data , and analyzed their advantages and disadvantages.Finally, we summarized how these detection algorithms were designed and classified them before we proposed ways of improvement .