新疆农业科学
新疆農業科學
신강농업과학
XINJIANG AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
11期
2059-2065
,共7页
楚敏%张志东%王玮%宋素琴%顾美英
楚敏%張誌東%王瑋%宋素琴%顧美英
초민%장지동%왕위%송소금%고미영
气单胞菌属%低温淀粉酶%基因克隆%生物信息学
氣單胞菌屬%低溫澱粉酶%基因剋隆%生物信息學
기단포균속%저온정분매%기인극륭%생물신식학
genus Aeromonas%cold-adapted amylase%gene cloning%bioinformatics analysis
[目的]获得低温菌LA77的低温淀粉酶基因及其生物学信息.[方法]用16S rDNA序列分析对其进行了分子鉴定,并根据分类地位进行了特异引物设计和PCR扩增,通过生物学网站和软件对获得的基因及编码蛋白进行分析.[结果]低温菌LA77归属于气单胞菌属,PCR扩增获得一条编码703个氨基酸的完整开放阅读框的基因.通过生物信息学分析显示该蛋白质理论分子量约为77.9 kD,等电点为6.16,为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白.可能存在10个磷酸化位点,1个糖基化位点,二级结构主要由α螺旋和随机卷曲构成.基于氨基酸序列的结构域和系统进化树分析表明,该蛋白属于α-淀粉酶家族,极可能为低温淀粉酶.[结论]LA77低温淀粉酶基因的获得,将为低温淀粉酶基因的进一步改造、表达以及其酶低温催化机理的阐释奠定重要的基础.
[目的]穫得低溫菌LA77的低溫澱粉酶基因及其生物學信息.[方法]用16S rDNA序列分析對其進行瞭分子鑒定,併根據分類地位進行瞭特異引物設計和PCR擴增,通過生物學網站和軟件對穫得的基因及編碼蛋白進行分析.[結果]低溫菌LA77歸屬于氣單胞菌屬,PCR擴增穫得一條編碼703箇氨基痠的完整開放閱讀框的基因.通過生物信息學分析顯示該蛋白質理論分子量約為77.9 kD,等電點為6.16,為親水、且具有信號肽的跨膜蛋白.可能存在10箇燐痠化位點,1箇糖基化位點,二級結構主要由α螺鏇和隨機捲麯構成.基于氨基痠序列的結構域和繫統進化樹分析錶明,該蛋白屬于α-澱粉酶傢族,極可能為低溫澱粉酶.[結論]LA77低溫澱粉酶基因的穫得,將為低溫澱粉酶基因的進一步改造、錶達以及其酶低溫催化機理的闡釋奠定重要的基礎.
[목적]획득저온균LA77적저온정분매기인급기생물학신식.[방법]용16S rDNA서렬분석대기진행료분자감정,병근거분류지위진행료특이인물설계화PCR확증,통과생물학망참화연건대획득적기인급편마단백진행분석.[결과]저온균LA77귀속우기단포균속,PCR확증획득일조편마703개안기산적완정개방열독광적기인.통과생물신식학분석현시해단백질이론분자량약위77.9 kD,등전점위6.16,위친수、차구유신호태적과막단백.가능존재10개린산화위점,1개당기화위점,이급결구주요유α라선화수궤권곡구성.기우안기산서렬적결구역화계통진화수분석표명,해단백속우α-정분매가족,겁가능위저온정분매.[결론]LA77저온정분매기인적획득,장위저온정분매기인적진일보개조、표체이급기매저온최화궤리적천석전정중요적기출.
