福州大学学报（自然科学版）
福州大學學報（自然科學版）
복주대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF FUZHOU UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2014年
6期
834-840
,共7页
蛋白质相互作用%SVM%结构域%混合核函数
蛋白質相互作用%SVM%結構域%混閤覈函數
단백질상호작용%SVM%결구역%혼합핵함수
protein-protein interaction%SVM%domain%hybrid kernel function
针对蛋白质相互作用的预测问题,提出一种以余弦核和线性差值累加核为基核的对偶混合核函数SVM的蛋白质相互作用预测方法.该方法充分考虑了蛋白质的结构域特征,同时根据蛋白质相互作用数据应具有顺序无关的特点,将“对偶”思想引入SVM核函数中.对两个真实的蛋白质相互作用数据集Yeast PPI和Human PPI的测试结果表明,提出的方法与其它方法相比能够有效地提高蛋白质相互作用预测的准确率.
針對蛋白質相互作用的預測問題,提齣一種以餘絃覈和線性差值纍加覈為基覈的對偶混閤覈函數SVM的蛋白質相互作用預測方法.該方法充分攷慮瞭蛋白質的結構域特徵,同時根據蛋白質相互作用數據應具有順序無關的特點,將“對偶”思想引入SVM覈函數中.對兩箇真實的蛋白質相互作用數據集Yeast PPI和Human PPI的測試結果錶明,提齣的方法與其它方法相比能夠有效地提高蛋白質相互作用預測的準確率.
침대단백질상호작용적예측문제,제출일충이여현핵화선성차치루가핵위기핵적대우혼합핵함수SVM적단백질상호작용예측방법.해방법충분고필료단백질적결구역특정,동시근거단백질상호작용수거응구유순서무관적특점,장“대우”사상인입SVM핵함수중.대량개진실적단백질상호작용수거집Yeast PPI화Human PPI적측시결과표명,제출적방법여기타방법상비능구유효지제고단백질상호작용예측적준학솔.
