西南农业学报
西南農業學報
서남농업학보
SOUTHWEST CHINA JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
6期
2259-2266
,共8页
邹智%谢贵水%莫业勇%安锋%杨礼富
鄒智%謝貴水%莫業勇%安鋒%楊禮富
추지%사귀수%막업용%안봉%양례부
大戟科植物%全基因组%HMCS基因家族
大戟科植物%全基因組%HMCS基因傢族
대극과식물%전기인조%HMCS기인가족
Euphorbiaceae%plant%Genome-wide%HMGS%gene%family
3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A合酶(HMGS)是甲羟戊酸(MVA)代谢途径中的关键酶,催化乙酰-CoA和乙酰乙酰-CoA缩合形成戊二酸单酰辅酶A (HMG-CoA).研究基于蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树已释放的基因组和EST数据,对这4种大戟科植物的HMGS基因进行了系统鉴定,并在此基础上分析了其基因结构与进化关系.结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有1、1、2和2个HMGS基因,所有基因均包含11个内含子.同源分析表明,HMGS广泛存在于各种古细菌、真细菌和真核生物中,显示出较早的起源.在大多基因组已测序的绿色植物中,HMGS主要以单拷贝的形式存在,其中包括团藻、拟南芥、蓖麻和麻疯树,但在木薯和橡胶树中基因出现了加倍现象,这与小立碗藓、水稻和杨树类似.基因表达谱分析显示,在蓖麻的叶片、花、Ⅱ/ⅢⅡ期胚乳、Ⅴ/Ⅵ期胚乳和种子等组织中,RcHMGS在花和Ⅱ/Ⅲ期胚乳中的表达丰度较高,Ⅴ/Ⅵ期胚乳和叶片中次之,种子中最低.
3-羥基-3-甲基戊二痠單酰輔酶A閤酶(HMGS)是甲羥戊痠(MVA)代謝途徑中的關鍵酶,催化乙酰-CoA和乙酰乙酰-CoA縮閤形成戊二痠單酰輔酶A (HMG-CoA).研究基于蓖痳、痳瘋樹、木藷和橡膠樹已釋放的基因組和EST數據,對這4種大戟科植物的HMGS基因進行瞭繫統鑒定,併在此基礎上分析瞭其基因結構與進化關繫.結果錶明,蓖痳、痳瘋樹、木藷和橡膠樹分彆含有1、1、2和2箇HMGS基因,所有基因均包含11箇內含子.同源分析錶明,HMGS廣汎存在于各種古細菌、真細菌和真覈生物中,顯示齣較早的起源.在大多基因組已測序的綠色植物中,HMGS主要以單拷貝的形式存在,其中包括糰藻、擬南芥、蓖痳和痳瘋樹,但在木藷和橡膠樹中基因齣現瞭加倍現象,這與小立碗蘚、水稻和楊樹類似.基因錶達譜分析顯示,在蓖痳的葉片、花、Ⅱ/ⅢⅡ期胚乳、Ⅴ/Ⅵ期胚乳和種子等組織中,RcHMGS在花和Ⅱ/Ⅲ期胚乳中的錶達豐度較高,Ⅴ/Ⅵ期胚乳和葉片中次之,種子中最低.
3-간기-3-갑기무이산단선보매A합매(HMGS)시갑간무산(MVA)대사도경중적관건매,최화을선-CoA화을선을선-CoA축합형성무이산단선보매A (HMG-CoA).연구기우비마、마풍수、목서화상효수이석방적기인조화EST수거,대저4충대극과식물적HMGS기인진행료계통감정,병재차기출상분석료기기인결구여진화관계.결과표명,비마、마풍수、목서화상효수분별함유1、1、2화2개HMGS기인,소유기인균포함11개내함자.동원분석표명,HMGS엄범존재우각충고세균、진세균화진핵생물중,현시출교조적기원.재대다기인조이측서적록색식물중,HMGS주요이단고패적형식존재,기중포괄단조、의남개、비마화마풍수,단재목서화상효수중기인출현료가배현상,저여소립완선、수도화양수유사.기인표체보분석현시,재비마적협편、화、Ⅱ/ⅢⅡ기배유、Ⅴ/Ⅵ기배유화충자등조직중,RcHMGS재화화Ⅱ/Ⅲ기배유중적표체봉도교고,Ⅴ/Ⅵ기배유화협편중차지,충자중최저.