家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2014年
11期
11-17
,共7页
海汀%柴志欣%张成福%信金伟%姬秋梅%曾贤彬%钟金城
海汀%柴誌訢%張成福%信金偉%姬鞦梅%曾賢彬%鐘金城
해정%시지흔%장성복%신금위%희추매%증현빈%종금성
西藏牦牛%mtDNA ND6基因%遗传多样性%系统进化
西藏牦牛%mtDNA ND6基因%遺傳多樣性%繫統進化
서장모우%mtDNA ND6기인%유전다양성%계통진화
Tibetan yak%mtDNA ND6%genetic diversity%phylogenetic
为从分子水平上探究西藏牦牛的序列多态性、遗传多态性及其系统进化关系,对西藏15个牦牛类群150个个体的mtDNA ND6基因全序列进行了测定,确定了多态位点和单倍型数目,计算了单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi),并构建了分子聚类关系图和单倍型系统发育树.结果表明:西藏牦牛mtDNA ND6基因全序列长度均为528 bp,T、C、A和G4种碱基的平均比例分别为42.2％、7.6％、20.9％、29.3％,存在一定的碱基组成偏倚性.序列变异中存在转换、颠换2种核苷酸变异类型,其中转换37次,颠换2次,表现出较强的转换偏倚性.根据序列间核苷酸变异共确定7种单倍型,其中Hap_1为西藏牦牛类群的主流单倍型,其余6种单倍型为部分类群所特有.平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.2978、0.00191,揭示西藏牦牛mtDNA ND6遗传多样性较贫乏.根据遗传距离构建了分子聚类关系图,表明西藏15个牦牛类群可分为2大类;根据7种单倍型序列构建了单倍型系统发育树,表明西藏牦牛存在2个母系起源.
為從分子水平上探究西藏牦牛的序列多態性、遺傳多態性及其繫統進化關繫,對西藏15箇牦牛類群150箇箇體的mtDNA ND6基因全序列進行瞭測定,確定瞭多態位點和單倍型數目,計算瞭單倍型多樣性(Hd)和覈苷痠多樣性(Pi),併構建瞭分子聚類關繫圖和單倍型繫統髮育樹.結果錶明:西藏牦牛mtDNA ND6基因全序列長度均為528 bp,T、C、A和G4種堿基的平均比例分彆為42.2％、7.6％、20.9％、29.3％,存在一定的堿基組成偏倚性.序列變異中存在轉換、顛換2種覈苷痠變異類型,其中轉換37次,顛換2次,錶現齣較彊的轉換偏倚性.根據序列間覈苷痠變異共確定7種單倍型,其中Hap_1為西藏牦牛類群的主流單倍型,其餘6種單倍型為部分類群所特有.平均單倍型多樣性(Hd)、平均覈苷痠多樣性(Pi)分彆為0.2978、0.00191,揭示西藏牦牛mtDNA ND6遺傳多樣性較貧乏.根據遺傳距離構建瞭分子聚類關繫圖,錶明西藏15箇牦牛類群可分為2大類;根據7種單倍型序列構建瞭單倍型繫統髮育樹,錶明西藏牦牛存在2箇母繫起源.
위종분자수평상탐구서장모우적서렬다태성、유전다태성급기계통진화관계,대서장15개모우류군150개개체적mtDNA ND6기인전서렬진행료측정,학정료다태위점화단배형수목,계산료단배형다양성(Hd)화핵감산다양성(Pi),병구건료분자취류관계도화단배형계통발육수.결과표명:서장모우mtDNA ND6기인전서렬장도균위528 bp,T、C、A화G4충감기적평균비례분별위42.2％、7.6％、20.9％、29.3％,존재일정적감기조성편의성.서렬변이중존재전환、전환2충핵감산변이류형,기중전환37차,전환2차,표현출교강적전환편의성.근거서렬간핵감산변이공학정7충단배형,기중Hap_1위서장모우류군적주류단배형,기여6충단배형위부분류군소특유.평균단배형다양성(Hd)、평균핵감산다양성(Pi)분별위0.2978、0.00191,게시서장모우mtDNA ND6유전다양성교빈핍.근거유전거리구건료분자취류관계도,표명서장15개모우류군가분위2대류;근거7충단배형서렬구건료단배형계통발육수,표명서장모우존재2개모계기원.
