安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2015年
3期
18-21,46
,共5页
张贺翠%廉小平%柳菁%李帮秀%周燕
張賀翠%廉小平%柳菁%李幫秀%週燕
장하취%렴소평%류정%리방수%주연
ROH1基因%基因克隆%DUF793蛋白超家族
ROH1基因%基因剋隆%DUF793蛋白超傢族
ROH1기인%기인극륭%DUF793단백초가족
ROH1 gene%Gene clone%DUF793 protein super family
[目的]通过PCR和RT-PCR技术从甘蓝、白菜和萝卜中扩增ROH1基因序列,分析该基因的基本特性.[方法]采用生物信息学的相关方法进行分析.[结果]甘蓝、白菜、萝卜 ROH1基因没有内含子,甘蓝ROH1基因编码398个氨基酸,白菜和萝卜ROH1基因均编码400个氨基酸,3种植物的ROH1蛋白序列与拟南芥已经公布的ROH1(At1 g63930)蛋白氨基酸缺少一段连续的氨基酸序列;ROH1属于DUF793蛋白超家族,它没有跨膜结构域和信号肽,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成.同源比对及功能联想分析发现植物中ROH1非常保守,系统发育分析表明甘蓝、白菜和萝卜的关系最近;结构功能分析发现ROH1可能与BYPASS蛋白和AT4G11300蛋白的功能相似.[结论]为研究DUF793蛋白超家族功能提供参考.
[目的]通過PCR和RT-PCR技術從甘藍、白菜和蘿蔔中擴增ROH1基因序列,分析該基因的基本特性.[方法]採用生物信息學的相關方法進行分析.[結果]甘藍、白菜、蘿蔔 ROH1基因沒有內含子,甘藍ROH1基因編碼398箇氨基痠,白菜和蘿蔔ROH1基因均編碼400箇氨基痠,3種植物的ROH1蛋白序列與擬南芥已經公佈的ROH1(At1 g63930)蛋白氨基痠缺少一段連續的氨基痠序列;ROH1屬于DUF793蛋白超傢族,它沒有跨膜結構域和信號肽,二級結構主要由α-螺鏇和無規則捲麯構成.同源比對及功能聯想分析髮現植物中ROH1非常保守,繫統髮育分析錶明甘藍、白菜和蘿蔔的關繫最近;結構功能分析髮現ROH1可能與BYPASS蛋白和AT4G11300蛋白的功能相似.[結論]為研究DUF793蛋白超傢族功能提供參攷.
[목적]통과PCR화RT-PCR기술종감람、백채화라복중확증ROH1기인서렬,분석해기인적기본특성.[방법]채용생물신식학적상관방법진행분석.[결과]감람、백채、라복 ROH1기인몰유내함자,감람ROH1기인편마398개안기산,백채화라복ROH1기인균편마400개안기산,3충식물적ROH1단백서렬여의남개이경공포적ROH1(At1 g63930)단백안기산결소일단련속적안기산서렬;ROH1속우DUF793단백초가족,타몰유과막결구역화신호태,이급결구주요유α-라선화무규칙권곡구성.동원비대급공능련상분석발현식물중ROH1비상보수,계통발육분석표명감람、백채화라복적관계최근;결구공능분석발현ROH1가능여BYPASS단백화AT4G11300단백적공능상사.[결론]위연구DUF793단백초가족공능제공삼고.
