CAJ | 학술논문

利用生物信息学方法搜索猪全基因组中完整型微卫星序列,并对其基因组中微卫星数量、频率以及分布规律进行了研究.搜索到猪全基因组中1～6个碱基重复类型微卫星位点数为1 149 884个,占其全基因组长度的比率为0.85％,出现频率为1/2.22 kb.猪第1条染色体(143 330个)中微卫星数量最多,其次是第2、6和13条染色体,而较少的是第12、18条染色体和Y染色体.猪性染色体X和Y序列长度差异极显著,X染色体序列长度是Y染色体的88.10倍,其微卫星数量也存在明显差异(58 437 w 814).通过检验表明,猪染色体长度与其所含微卫星数量具有高度正相关性(r=0.913,P＜0.01).猪全基因组中完整型微卫星各重复类型中,单碱基重复类型数量最多,占其微卫星总数量的比率为62.95％;其次依次是二碱基、四碱基、三碱基、五碱基、六碱基重复类型.猪全基因组中微卫星重复拷贝类别数量较多的是A、AC、AT、AAC、AAT、AAATAAAC、AAAG、AAGG,而数量较少的是C、CG、AGC、AGT、ACT、AGCG、AGTC、ACTG和CCGG.
이용생물신식학방법수색저전기인조중완정형미위성서렬,병대기기인조중미위성수량、빈솔이급분포규률진행료연구.수색도저전기인조중1～6개감기중복류형미위성위점수위1 149 884개,점기전기인조장도적비솔위0.85％,출현빈솔위1/2.22 kb.저제1조염색체(143 330개)중미위성수량최다,기차시제2、6화13조염색체,이교소적시제12、18조염색체화Y염색체.저성염색체X화Y서렬장도차이겁현저,X염색체서렬장도시Y염색체적88.10배,기미위성수량야존재명현차이(58 437 w 814).통과검험표명,저염색체장도여기소함미위성수량구유고도정상관성(r=0.913,P＜0.01).저전기인조중완정형미위성각중복류형중,단감기중복류형수량최다,점기미위성총수량적비솔위62.95％;기차의차시이감기、사감기、삼감기、오감기、륙감기중복류형.저전기인조중미위성중복고패유별수량교다적시A、AC、AT、AAC、AAT、AAATAAAC、AAAG、AAGG,이수량교소적시C、CG、AGC、AGT、ACT、AGCG、AGTC、ACTG화CCGG.