中国油料作物学报
中國油料作物學報
중국유료작물학보
CHINESE JOURNAL OF OIL CROP SCIENCES
2014年
6期
701-706
,共6页
陈夕军%张磊%陈羽%张家豪%童蕴慧%徐敬友
陳夕軍%張磊%陳羽%張傢豪%童蘊慧%徐敬友
진석군%장뢰%진우%장가호%동온혜%서경우
多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白%原核表达%生物信息学分析%核盘菌
多聚半乳糖醛痠酶抑製蛋白%原覈錶達%生物信息學分析%覈盤菌
다취반유당철산매억제단백%원핵표체%생물신식학분석%핵반균
Polygalacturonase-inhibiting protein%Prokaryotic expression%Bioinformatics analysis%Sclerotinia sclerotiorum
据GenBank及相关文献提供的序列设计引物,从油菜基因组DNA中扩增出Bnpgip2-1基因完整开放阅读框.该基因全长1 068bp,与已发表的Bnpgip2基因序列(登录号:AF529694)有98％的相似性.RT-PCR分析表明,该基因(已申请序列号为KJ820998)具一个72bp的内含子(544-615),编码区为996bp,含4个限制性内切酶酶切位点(Ava Ⅰ,185;HindⅢ,536;EcoR Ⅰ,929;ApaL Ⅰ,972).原核表达该基因,表达产物能显著抑制油菜菌核病菌多聚半乳糖醛酸酶(PG)活性,抑制率达52.96％.生物信息学分析表明,表达产物BnPGIP2-1有331个氨基酸,理论分子量为36.99kDa,pI为8.35,具强疏水性,主要存在于细胞壁.信号肽切点位于第22和23位氨基酸之间(SFS-KNL),N端和C端各存在5个和3个半胱氨酸残基,可形成3个二硫键;二级结构以α-螺旋(31.12％)、β折叠(16.01％)和无规则线圈(52.87％)为结构元件,具典型的LRR结构;三级结构为10个LRR按右手螺旋规则形成的一个开放裂隙区,可能负责其与病菌PG的互作.该基因的表达受病原菌侵染的强烈诱导,但对水杨酸(SA)处理不敏感,茉莉酸(JA)处理反而使其下调表达.
據GenBank及相關文獻提供的序列設計引物,從油菜基因組DNA中擴增齣Bnpgip2-1基因完整開放閱讀框.該基因全長1 068bp,與已髮錶的Bnpgip2基因序列(登錄號:AF529694)有98％的相似性.RT-PCR分析錶明,該基因(已申請序列號為KJ820998)具一箇72bp的內含子(544-615),編碼區為996bp,含4箇限製性內切酶酶切位點(Ava Ⅰ,185;HindⅢ,536;EcoR Ⅰ,929;ApaL Ⅰ,972).原覈錶達該基因,錶達產物能顯著抑製油菜菌覈病菌多聚半乳糖醛痠酶(PG)活性,抑製率達52.96％.生物信息學分析錶明,錶達產物BnPGIP2-1有331箇氨基痠,理論分子量為36.99kDa,pI為8.35,具彊疏水性,主要存在于細胞壁.信號肽切點位于第22和23位氨基痠之間(SFS-KNL),N耑和C耑各存在5箇和3箇半胱氨痠殘基,可形成3箇二硫鍵;二級結構以α-螺鏇(31.12％)、β摺疊(16.01％)和無規則線圈(52.87％)為結構元件,具典型的LRR結構;三級結構為10箇LRR按右手螺鏇規則形成的一箇開放裂隙區,可能負責其與病菌PG的互作.該基因的錶達受病原菌侵染的彊烈誘導,但對水楊痠(SA)處理不敏感,茉莉痠(JA)處理反而使其下調錶達.
거GenBank급상관문헌제공적서렬설계인물,종유채기인조DNA중확증출Bnpgip2-1기인완정개방열독광.해기인전장1 068bp,여이발표적Bnpgip2기인서렬(등록호:AF529694)유98％적상사성.RT-PCR분석표명,해기인(이신청서렬호위KJ820998)구일개72bp적내함자(544-615),편마구위996bp,함4개한제성내절매매절위점(Ava Ⅰ,185;HindⅢ,536;EcoR Ⅰ,929;ApaL Ⅰ,972).원핵표체해기인,표체산물능현저억제유채균핵병균다취반유당철산매(PG)활성,억제솔체52.96％.생물신식학분석표명,표체산물BnPGIP2-1유331개안기산,이론분자량위36.99kDa,pI위8.35,구강소수성,주요존재우세포벽.신호태절점위우제22화23위안기산지간(SFS-KNL),N단화C단각존재5개화3개반광안산잔기,가형성3개이류건;이급결구이α-라선(31.12％)、β절첩(16.01％)화무규칙선권(52.87％)위결구원건,구전형적LRR결구;삼급결구위10개LRR안우수라선규칙형성적일개개방렬극구,가능부책기여병균PG적호작.해기인적표체수병원균침염적강렬유도,단대수양산(SA)처리불민감,말리산(JA)처리반이사기하조표체.
