中国油料作物学报
中國油料作物學報
중국유료작물학보
CHINESE JOURNAL OF OIL CROP SCIENCES
2014年
6期
755-760
,共6页
袁翠平%赵洪锟%王玉民%刘晓冬%齐广勋%董英山
袁翠平%趙洪錕%王玉民%劉曉鼕%齊廣勛%董英山
원취평%조홍곤%왕옥민%류효동%제엄훈%동영산
野生大豆%大豆胞囊线虫%SHMT%序列多样性
野生大豆%大豆胞囊線蟲%SHMT%序列多樣性
야생대두%대두포낭선충%SHMT%서렬다양성
Wild soybean%Soybean cyst nematode%SHMT%Sequence diversity
大豆丝氨酸羟基转移酶(serine hydroxymethyltransferase)基因(SHMT)是Rhg4位点的抗胞囊线虫基因.本研究根据基因序列设计PCR引物对92份野生大豆进行了扩增,并对扩增产物测序,研究了其遗传多样性及其与大豆对胞囊线虫抗性的关系,旨在为野生大豆资源的合理利用提供参考.在供试的92份野生大豆SHMT序列(2 430bp)中,共发现了13个SNP位点(7个转换,6个颠换)和4个Indel(均发生在非编码区),其中11个为简约信息位点;SHMT序列多样性为π=0.000 61和θ=0.001 06;多态性位点形成16个单倍型,其中9个单倍型的分布频率＞2％,单倍型多样性为0.855;Tajima's D、Fu and Li's D和Z检验发现野生大豆SHMT不存在选择压力;卡方测验表明野生大豆SHMT与大豆对胞囊线虫的抗性没有直接关联;采用UPGMA法构建的SHMT分子进化树表明,供试92份野生大豆被聚类在6个类群,并表现出种质间的遗传关系与其生态区有一定的联系.
大豆絲氨痠羥基轉移酶(serine hydroxymethyltransferase)基因(SHMT)是Rhg4位點的抗胞囊線蟲基因.本研究根據基因序列設計PCR引物對92份野生大豆進行瞭擴增,併對擴增產物測序,研究瞭其遺傳多樣性及其與大豆對胞囊線蟲抗性的關繫,旨在為野生大豆資源的閤理利用提供參攷.在供試的92份野生大豆SHMT序列(2 430bp)中,共髮現瞭13箇SNP位點(7箇轉換,6箇顛換)和4箇Indel(均髮生在非編碼區),其中11箇為簡約信息位點;SHMT序列多樣性為π=0.000 61和θ=0.001 06;多態性位點形成16箇單倍型,其中9箇單倍型的分佈頻率＞2％,單倍型多樣性為0.855;Tajima's D、Fu and Li's D和Z檢驗髮現野生大豆SHMT不存在選擇壓力;卡方測驗錶明野生大豆SHMT與大豆對胞囊線蟲的抗性沒有直接關聯;採用UPGMA法構建的SHMT分子進化樹錶明,供試92份野生大豆被聚類在6箇類群,併錶現齣種質間的遺傳關繫與其生態區有一定的聯繫.
대두사안산간기전이매(serine hydroxymethyltransferase)기인(SHMT)시Rhg4위점적항포낭선충기인.본연구근거기인서렬설계PCR인물대92빈야생대두진행료확증,병대확증산물측서,연구료기유전다양성급기여대두대포낭선충항성적관계,지재위야생대두자원적합리이용제공삼고.재공시적92빈야생대두SHMT서렬(2 430bp)중,공발현료13개SNP위점(7개전환,6개전환)화4개Indel(균발생재비편마구),기중11개위간약신식위점;SHMT서렬다양성위π=0.000 61화θ=0.001 06;다태성위점형성16개단배형,기중9개단배형적분포빈솔＞2％,단배형다양성위0.855;Tajima's D、Fu and Li's D화Z검험발현야생대두SHMT불존재선택압력;잡방측험표명야생대두SHMT여대두대포낭선충적항성몰유직접관련;채용UPGMA법구건적SHMT분자진화수표명,공시92빈야생대두피취류재6개류군,병표현출충질간적유전관계여기생태구유일정적련계.
