智能计算机与应用
智能計算機與應用
지능계산궤여응용
Computer Study
2014年
6期
25-27,30
,共4页
高通量测序技术Chip-seq%数据的正规化%基因组功能注释%LOWESS正规化方法
高通量測序技術Chip-seq%數據的正規化%基因組功能註釋%LOWESS正規化方法
고통량측서기술Chip-seq%수거적정규화%기인조공능주석%LOWESS정규화방법
本文针对目前生物信息研究中常见的高通量测序技术Chip-seq数据的正规化问题进行了研究.分析了目前常用的TMR正规化方法和LOWESS正规化方法中没有考虑到基因组的结构对于生物数据分布的影响这一不足,提出了一种新的基于基因组功能注释的LOWESS正规化方法.该方法更符合基因组生物学特征,可以根据基因组本身不同的生物学功能的差异,分区域、分类别进行数据正规化处理,更符合基因组的生物学特征,也具有更高的可靠性.同时可以针对不同研究目的,依据不同的功能区域注释信息有针对性的对该区域进行正规化,具有更高的特异性和灵活性以及更低的时间和空间复杂度.
本文針對目前生物信息研究中常見的高通量測序技術Chip-seq數據的正規化問題進行瞭研究.分析瞭目前常用的TMR正規化方法和LOWESS正規化方法中沒有攷慮到基因組的結構對于生物數據分佈的影響這一不足,提齣瞭一種新的基于基因組功能註釋的LOWESS正規化方法.該方法更符閤基因組生物學特徵,可以根據基因組本身不同的生物學功能的差異,分區域、分類彆進行數據正規化處理,更符閤基因組的生物學特徵,也具有更高的可靠性.同時可以針對不同研究目的,依據不同的功能區域註釋信息有針對性的對該區域進行正規化,具有更高的特異性和靈活性以及更低的時間和空間複雜度.
본문침대목전생물신식연구중상견적고통량측서기술Chip-seq수거적정규화문제진행료연구.분석료목전상용적TMR정규화방법화LOWESS정규화방법중몰유고필도기인조적결구대우생물수거분포적영향저일불족,제출료일충신적기우기인조공능주석적LOWESS정규화방법.해방법경부합기인조생물학특정,가이근거기인조본신불동적생물학공능적차이,분구역、분유별진행수거정규화처리,경부합기인조적생물학특정,야구유경고적가고성.동시가이침대불동연구목적,의거불동적공능구역주석신식유침대성적대해구역진행정규화,구유경고적특이성화령활성이급경저적시간화공간복잡도.
