中国水产科学
中國水產科學
중국수산과학
Journal of Fishery Sciences of China
2015年
2期
347-352
,共6页
王桂兴%刘永新%王玉芬%姜秀凤%刘海金
王桂興%劉永新%王玉芬%薑秀鳳%劉海金
왕계흥%류영신%왕옥분%강수봉%류해금
牙鲆%GH基因%SNPs%生长性状
牙鲆%GH基因%SNPs%生長性狀
아평%GH기인%SNPs%생장성상
Paralichthys olivaceus%growth hormone gene: SNPs%growth traits
以雌核发育牙鲆(Paralichthys olivaceus)为对象,根据GenBank收录的牙鲆生长激素基因序列(GenBank登录号:D29737)设计9对引物,采用直接测序的方法对50尾雌核发育牙鲆生长激素基因编码区和启动子进行了单核苷酸多态位点(SNPs)筛选,共获得有效序列1 838 bp,启动子区117 bp,内含子区1 050 bp,外显子区671 bp,覆盖牙鲆生长激素基因78.3％的序列.共检测到7个SNPs,平均发生频率为0.38/100个碱基,其中颠换型3个,插入型2个,缺失型2个;内含子区4个(Intron Ⅰ:C477T、1 091～1 092/insert T、1 129～1 130/insert A; Intron Ⅳ:1 906A/-del),外显子区3个(ExonⅤ:2067T/-del、A2006C、A1974G); SNPs与生长性状相关分析结果显示:C477T和2 067T/-del两个位点对牙鲆的体重、体长、体高等生长性状均有显著影响(P＜0.05),其他5个SNPs对牙鲆生长性状均无显著影响(P＞0.05).研究结果可为牙鲆生长性状的SNPs标记辅助选育提供基础数据.
以雌覈髮育牙鲆(Paralichthys olivaceus)為對象,根據GenBank收錄的牙鲆生長激素基因序列(GenBank登錄號:D29737)設計9對引物,採用直接測序的方法對50尾雌覈髮育牙鲆生長激素基因編碼區和啟動子進行瞭單覈苷痠多態位點(SNPs)篩選,共穫得有效序列1 838 bp,啟動子區117 bp,內含子區1 050 bp,外顯子區671 bp,覆蓋牙鲆生長激素基因78.3％的序列.共檢測到7箇SNPs,平均髮生頻率為0.38/100箇堿基,其中顛換型3箇,插入型2箇,缺失型2箇;內含子區4箇(Intron Ⅰ:C477T、1 091～1 092/insert T、1 129～1 130/insert A; Intron Ⅳ:1 906A/-del),外顯子區3箇(ExonⅤ:2067T/-del、A2006C、A1974G); SNPs與生長性狀相關分析結果顯示:C477T和2 067T/-del兩箇位點對牙鲆的體重、體長、體高等生長性狀均有顯著影響(P＜0.05),其他5箇SNPs對牙鲆生長性狀均無顯著影響(P＞0.05).研究結果可為牙鲆生長性狀的SNPs標記輔助選育提供基礎數據.
이자핵발육아평(Paralichthys olivaceus)위대상,근거GenBank수록적아평생장격소기인서렬(GenBank등록호:D29737)설계9대인물,채용직접측서적방법대50미자핵발육아평생장격소기인편마구화계동자진행료단핵감산다태위점(SNPs)사선,공획득유효서렬1 838 bp,계동자구117 bp,내함자구1 050 bp,외현자구671 bp,복개아평생장격소기인78.3％적서렬.공검측도7개SNPs,평균발생빈솔위0.38/100개감기,기중전환형3개,삽입형2개,결실형2개;내함자구4개(Intron Ⅰ:C477T、1 091～1 092/insert T、1 129～1 130/insert A; Intron Ⅳ:1 906A/-del),외현자구3개(ExonⅤ:2067T/-del、A2006C、A1974G); SNPs여생장성상상관분석결과현시:C477T화2 067T/-del량개위점대아평적체중、체장、체고등생장성상균유현저영향(P＜0.05),기타5개SNPs대아평생장성상균무현저영향(P＞0.05).연구결과가위아평생장성상적SNPs표기보조선육제공기출수거.
