浙江农林大学学报
浙江農林大學學報
절강농림대학학보
JOURNAL OF ZHEJIANG FORESTRY COLLEGE
2015年
2期
229-236
,共8页
黄银芝%曾燕如%周秦%夏国华%黄有军
黃銀芝%曾燕如%週秦%夏國華%黃有軍
황은지%증연여%주진%하국화%황유군
经济林学%山核桃%表达序列标签%功能分类%脂肪代谢%蛋白分析
經濟林學%山覈桃%錶達序列標籤%功能分類%脂肪代謝%蛋白分析
경제림학%산핵도%표체서렬표첨%공능분류%지방대사%단백분석
cash forestry%Carya cathayensis%expressed sequence tag%functional classification%fatty acid metabolism%protein analysis
山核桃Carya cathayensis为重要的油料干果树种,其非同一般的高含油率必定有其特殊的成油机制.为探索其成油机制,在已构建的山核桃脂肪代谢相关cDNA文库基础上,对cDNA进行随机克隆测序,对序列进行拼接、功能注释,基因本体论(gene ontology,GO)分类及基于拟南芥Arab idopsis thaliana的FunCat分类,并对与脂肪代谢相关的全长cDNA序列进行蛋白性质分析.结果共得到1 010条山核桃表达序列标签(ESTs),经拼接获得188个编码蛋白质的基因(unigene),其中92个contigs和96个singlets.GO分类将这些unigene分成细胞组分、分子功能和生物过程等3类,并发现各序列编码的基因并不承担单一的功能,有些序列在功能上有重叠;同时参照拟南芥的基因功能分类,将unigene序列在功能上分成9类,得到了143个全长cDNA序列,其中包括14个与脂肪代谢相关的cDNA序列.对12个与脂肪代谢相关的全长cDNA序列进行蛋白性质分析,发现它们均具有磷酸化位点;除油质蛋白外都没有跨膜区域,且不具信号肽结构,为非分泌蛋白,属于某个蛋白家族;不同的油体蛋白具有不同的跨膜区,且均具有信号肽结构,属于Oleosin super family蛋白家族.
山覈桃Carya cathayensis為重要的油料榦果樹種,其非同一般的高含油率必定有其特殊的成油機製.為探索其成油機製,在已構建的山覈桃脂肪代謝相關cDNA文庫基礎上,對cDNA進行隨機剋隆測序,對序列進行拼接、功能註釋,基因本體論(gene ontology,GO)分類及基于擬南芥Arab idopsis thaliana的FunCat分類,併對與脂肪代謝相關的全長cDNA序列進行蛋白性質分析.結果共得到1 010條山覈桃錶達序列標籤(ESTs),經拼接穫得188箇編碼蛋白質的基因(unigene),其中92箇contigs和96箇singlets.GO分類將這些unigene分成細胞組分、分子功能和生物過程等3類,併髮現各序列編碼的基因併不承擔單一的功能,有些序列在功能上有重疊;同時參照擬南芥的基因功能分類,將unigene序列在功能上分成9類,得到瞭143箇全長cDNA序列,其中包括14箇與脂肪代謝相關的cDNA序列.對12箇與脂肪代謝相關的全長cDNA序列進行蛋白性質分析,髮現它們均具有燐痠化位點;除油質蛋白外都沒有跨膜區域,且不具信號肽結構,為非分泌蛋白,屬于某箇蛋白傢族;不同的油體蛋白具有不同的跨膜區,且均具有信號肽結構,屬于Oleosin super family蛋白傢族.
산핵도Carya cathayensis위중요적유료간과수충,기비동일반적고함유솔필정유기특수적성유궤제.위탐색기성유궤제,재이구건적산핵도지방대사상관cDNA문고기출상,대cDNA진행수궤극륭측서,대서렬진행병접、공능주석,기인본체론(gene ontology,GO)분류급기우의남개Arab idopsis thaliana적FunCat분류,병대여지방대사상관적전장cDNA서렬진행단백성질분석.결과공득도1 010조산핵도표체서렬표첨(ESTs),경병접획득188개편마단백질적기인(unigene),기중92개contigs화96개singlets.GO분류장저사unigene분성세포조분、분자공능화생물과정등3류,병발현각서렬편마적기인병불승담단일적공능,유사서렬재공능상유중첩;동시삼조의남개적기인공능분류,장unigene서렬재공능상분성9류,득도료143개전장cDNA서렬,기중포괄14개여지방대사상관적cDNA서렬.대12개여지방대사상관적전장cDNA서렬진행단백성질분석,발현타문균구유린산화위점;제유질단백외도몰유과막구역,차불구신호태결구,위비분비단백,속우모개단백가족;불동적유체단백구유불동적과막구,차균구유신호태결구,속우Oleosin super family단백가족.
