中国科技论文
中國科技論文
중국과기논문
Sciencepaper Online
2015年
2期
186-191
,共6页
黄冬丽%郭茂祖%李晋%刘晓燕%王春宇
黃鼕麗%郭茂祖%李晉%劉曉燕%王春宇
황동려%곽무조%리진%류효연%왕춘우
复杂疾病%基因互作%整体基因%信息增益
複雜疾病%基因互作%整體基因%信息增益
복잡질병%기인호작%정체기인%신식증익
复杂疾病一般由多个基因共同作用发生,单个基因的效应微小,为了更好地研究基因互作对复杂疾病的影响,提出了一种基于基因的信息增益模型.信息增益在分类系统中指变量为分类带来信息的多少,带来的信息越多,该变量对分类越重要.该模型从一个整体基因的所有单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)出发,采用病例-对照数据来检测基因互作对疾病的影响.由于基因是功能表达的最小单位,与基于SNP的交互作用分析方法相比,该模型更能从生物学的角度解释疾病的遗传机制.最后,采用模拟数据和类风湿性关节炎疾病的真实数据进行实验,并与基于SNP的熵模型以及基于基因的核典型相关分析模型(kernel canonical corelation based U statistic,KCCU)两种模型比较,结果均验证了该模型的有效性.
複雜疾病一般由多箇基因共同作用髮生,單箇基因的效應微小,為瞭更好地研究基因互作對複雜疾病的影響,提齣瞭一種基于基因的信息增益模型.信息增益在分類繫統中指變量為分類帶來信息的多少,帶來的信息越多,該變量對分類越重要.該模型從一箇整體基因的所有單覈苷痠多態性位點(single nucleotide polymorphism,SNP)齣髮,採用病例-對照數據來檢測基因互作對疾病的影響.由于基因是功能錶達的最小單位,與基于SNP的交互作用分析方法相比,該模型更能從生物學的角度解釋疾病的遺傳機製.最後,採用模擬數據和類風濕性關節炎疾病的真實數據進行實驗,併與基于SNP的熵模型以及基于基因的覈典型相關分析模型(kernel canonical corelation based U statistic,KCCU)兩種模型比較,結果均驗證瞭該模型的有效性.
복잡질병일반유다개기인공동작용발생,단개기인적효응미소,위료경호지연구기인호작대복잡질병적영향,제출료일충기우기인적신식증익모형.신식증익재분류계통중지변량위분류대래신식적다소,대래적신식월다,해변량대분류월중요.해모형종일개정체기인적소유단핵감산다태성위점(single nucleotide polymorphism,SNP)출발,채용병례-대조수거래검측기인호작대질병적영향.유우기인시공능표체적최소단위,여기우SNP적교호작용분석방법상비,해모형경능종생물학적각도해석질병적유전궤제.최후,채용모의수거화류풍습성관절염질병적진실수거진행실험,병여기우SNP적적모형이급기우기인적핵전형상관분석모형(kernel canonical corelation based U statistic,KCCU)량충모형비교,결과균험증료해모형적유효성.