湖泊科学
湖泊科學
호박과학
JOURNAL OF LAKE SCIENCES
2015年
2期
305-310
,共6页
徐敏%邓道贵%张海军%王文平%晁秋杰
徐敏%鄧道貴%張海軍%王文平%晁鞦傑
서민%산도귀%장해군%왕문평%조추걸
裸腹溞%16S rDNA%系统分类
裸腹溞%16S rDNA%繫統分類
라복소%16S rDNA%계통분류
Moina%16S rDNA%systematic classification
为了检验已记录的3种裸腹溞(发头裸腹溞(Moina irrasa)、短型裸腹溞(Moina brachiata)、微型裸腹溞(Moina micrura))的系统分类,用试剂盒法分别提取3种裸腹溞的基因组DNA.利用特异性引物,通过PCR扩增了3种裸腹溞的16S rDNA部分序列,并与来自GenBank中每个种类相似度较高的裸腹溞属序列进行分析.结果表明,3种裸腹溞的平均种间相似度为88.7%,碱基中A+T含量均明显高于G+C含量.本研究的发头裸腹溞的16S rDNA序列与GenBank所下载的多刺裸腹溞(Moina macrocopa)的16S rDNA序列相似度为99%,遗传距离(K2P双参考模型)为0.5%,属种内范围;两个地区的短型裸腹溞测得的16S rDNA序列与GenBank下载的欧洲短型裸腹溞的16S rDNA序列序列相似度相对较低(88%~90%),遗传距离较大(13.2% ~ 13.5%左右),已达到属内种间分化水平.基于16S rDNA构建的NJ树和贝叶斯树也支持以上结论.结果表明,本研究的发头裸腹溞可能为多刺裸腹溞,本研究用的短型裸腹溞与GenBank下载的欧洲短型裸腹溞已经达到种间分化的标准.由于缺乏物种形态资料和其他分子标记的对比,3种裸腹溞的分类地位还需进行更深入的探讨.
為瞭檢驗已記錄的3種裸腹溞(髮頭裸腹溞(Moina irrasa)、短型裸腹溞(Moina brachiata)、微型裸腹溞(Moina micrura))的繫統分類,用試劑盒法分彆提取3種裸腹溞的基因組DNA.利用特異性引物,通過PCR擴增瞭3種裸腹溞的16S rDNA部分序列,併與來自GenBank中每箇種類相似度較高的裸腹溞屬序列進行分析.結果錶明,3種裸腹溞的平均種間相似度為88.7%,堿基中A+T含量均明顯高于G+C含量.本研究的髮頭裸腹溞的16S rDNA序列與GenBank所下載的多刺裸腹溞(Moina macrocopa)的16S rDNA序列相似度為99%,遺傳距離(K2P雙參攷模型)為0.5%,屬種內範圍;兩箇地區的短型裸腹溞測得的16S rDNA序列與GenBank下載的歐洲短型裸腹溞的16S rDNA序列序列相似度相對較低(88%~90%),遺傳距離較大(13.2% ~ 13.5%左右),已達到屬內種間分化水平.基于16S rDNA構建的NJ樹和貝葉斯樹也支持以上結論.結果錶明,本研究的髮頭裸腹溞可能為多刺裸腹溞,本研究用的短型裸腹溞與GenBank下載的歐洲短型裸腹溞已經達到種間分化的標準.由于缺乏物種形態資料和其他分子標記的對比,3種裸腹溞的分類地位還需進行更深入的探討.
위료검험이기록적3충라복소(발두라복소(Moina irrasa)、단형라복소(Moina brachiata)、미형라복소(Moina micrura))적계통분류,용시제합법분별제취3충라복소적기인조DNA.이용특이성인물,통과PCR확증료3충라복소적16S rDNA부분서렬,병여래자GenBank중매개충류상사도교고적라복소속서렬진행분석.결과표명,3충라복소적평균충간상사도위88.7%,감기중A+T함량균명현고우G+C함량.본연구적발두라복소적16S rDNA서렬여GenBank소하재적다자라복소(Moina macrocopa)적16S rDNA서렬상사도위99%,유전거리(K2P쌍삼고모형)위0.5%,속충내범위;량개지구적단형라복소측득적16S rDNA서렬여GenBank하재적구주단형라복소적16S rDNA서렬서렬상사도상대교저(88%~90%),유전거리교대(13.2% ~ 13.5%좌우),이체도속내충간분화수평.기우16S rDNA구건적NJ수화패협사수야지지이상결론.결과표명,본연구적발두라복소가능위다자라복소,본연구용적단형라복소여GenBank하재적구주단형라복소이경체도충간분화적표준.유우결핍물충형태자료화기타분자표기적대비,3충라복소적분류지위환수진행경심입적탐토.