CAJ | 학술논문

[目的]对江西赣南柑橘果园感染衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)样品的外壳蛋白(CP)基因进行克隆及序列遗传信息分析,为利用弱毒株交叉保护法预防该地区CTV的蔓延奠定基础.[方法]运用RT-PCR扩增样品的CP基因并测序,应用软件检测CP序列基因重组,分析碱基含量,再将所测序列与10个外国CTV分离株计算核苷酸遗传距离,比对序列同源性及构建系统发育树.[结果]214份柑橘样品中有78份感染了CTV,发病率为36.4％.78个样品中仅有一个存在基因重组现象;78个CTV分离株CP基因全长序列均为672 bp,无碱基缺失、插入等现象,CP基因平均GC含量为52.8％,AT(U)为47.2％;所有样品核苷酸遗传距离在0～0.072,与10个已知CTV分离株CP基因核苷酸遗传距离在0～0.106.78个样品的CP基因核苷酸及其推导氨基酸序列同源性分别为89.1％～100.0％和92.3％～100.0％,与10株已知CTV分离株的同源性分别为76.5％～98.9％和73.6％～99.5％.系统进化分析结果表明,78个分离样品与10株已知CTV分离株可聚为四大类群,第Ⅰ类群包含49个分离样品和7个症状不同的已知CTV分离株(6个强毒型和1个弱毒型);第Ⅱ类群包含21个样品,国外强毒株系Qaha和引发茎陷点、速衰症状的Mexico-ctv株系聚于此类群;第Ⅲ类群仅由采自瑞金的CRJ14组成;第Ⅳ类群包括一个国外强毒株系HA16-5和采自江口、宁都的样品.[结论]赣南柑橘产区CTV分离株的CP基因保守性较高,序列存在一定程度的变异;各分离株间亲缘性较高但关系复杂,大部分样品与强毒型和茎陷点型分离株相关.
[목적]대강서공남감귤과완감염쇠퇴병독(Citrus tristeza virus,CTV)양품적외각단백(CP)기인진행극륭급서렬유전신식분석,위이용약독주교차보호법예방해지구CTV적만연전정기출.[방법]운용RT-PCR확증양품적CP기인병측서,응용연건검측CP서렬기인중조,분석감기함량,재장소측서렬여10개외국CTV분리주계산핵감산유전거리,비대서렬동원성급구건계통발육수.[결과]214빈감귤양품중유78빈감염료CTV,발병솔위36.4％.78개양품중부유일개존재기인중조현상;78개CTV분리주CP기인전장서렬균위672 bp,무감기결실、삽입등현상,CP기인평균GC함량위52.8％,AT(U)위47.2％;소유양품핵감산유전거리재0～0.072,여10개이지CTV분리주CP기인핵감산유전거리재0～0.106.78개양품적CP기인핵감산급기추도안기산서렬동원성분별위89.1％～100.0％화92.3％～100.0％,여10주이지CTV분리주적동원성분별위76.5％～98.9％화73.6％～99.5％.계통진화분석결과표명,78개분리양품여10주이지CTV분리주가취위사대류군,제Ⅰ류군포함49개분리양품화7개증상불동적이지CTV분리주(6개강독형화1개약독형);제Ⅱ류군포함21개양품,국외강독주계Qaha화인발경함점、속쇠증상적Mexico-ctv주계취우차류군;제Ⅲ류군부유채자서금적CRJ14조성;제Ⅳ류군포괄일개국외강독주계HA16-5화채자강구、저도적양품.[결론]공남감귤산구CTV분리주적CP기인보수성교고,서렬존재일정정도적변이;각분리주간친연성교고단관계복잡,대부분양품여강독형화경함점형분리주상관.